215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14280 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14280  glycerate kinase  100 
 
 		 396 aa  741    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000570843  normal  0.0813973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  49.32 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  45.99 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  47.03 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2549  glycerate kinase  51.04 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3439  Glycerate kinase  44.56 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3130  glycerate kinase  44.86 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00415476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0243  glycerate kinase  49.6 
 
 		 377 aa  245  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  41.79 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  49.24 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  48.18 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  42.82 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  43.23 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  40.71 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  42.42 
 
 		 380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  42.42 
 
 		 380 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  42.16 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  45.52 
 
 		 397 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  38.14 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  41.39 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  42.16 
 
 		 380 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  43.64 
 
 		 379 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  41.43 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  40.83 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  43.33 
 
 		 373 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  37.89 
 
 		 381 aa  227  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  36.98 
 
 		 381 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  36.98 
 
 		 408 aa  226  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  36.98 
 
 		 408 aa  226  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  36.98 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  36.98 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  36.98 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  36.88 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  43.5 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  39.29 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  40.4 
 
 		 380 aa  224  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  44.47 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  45.14 
 
 		 380 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  40.06 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  36.62 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  40.55 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  37.7 
 
 		 378 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  43.64 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  45.27 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  40.85 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  46.26 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  38.8 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  37.43 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  46.26 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  46.26 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  40.4 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  37.16 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4821  glycerate kinase  47.49 
 
 		 377 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  39.73 
 
 		 387 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  41.34 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  41.34 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  41.34 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  47.38 
 
 		 381 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08140  glycerate kinase  43.41 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  39.31 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  41.8 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  41.34 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  40.72 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  37.54 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  36.96 
 
 		 381 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  38 
 
 		 385 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  43.08 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  38 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0239  Glycerate kinase  43.73 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  38 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  39.82 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  38.29 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  38.29 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  37.43 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  35.58 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  35.95 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0572  glycerate kinase  42.02 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0411866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  35.04 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  40.79 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  39.52 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  40.79 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  35.41 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  37.22 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  35.84 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  35.75 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  41.88 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  42.21 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0123  glycerate kinase  41.73 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  37.29 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  41.64 
 
 		 395 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  40.21 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  35.84 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  44.31 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  37.54 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2253  glycerate kinase  38.75 
 
 		 380 aa  209  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.453069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  40 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  36.96 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  40.48 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  39.22 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  40.48 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>