More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14230 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  520  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  54.59 
 
 
239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  44.96 
 
 
274 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  47.75 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  51.32 
 
 
204 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  49.75 
 
 
261 aa  198  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  49.06 
 
 
277 aa  198  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  49.22 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  49.75 
 
 
249 aa  192  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  50 
 
 
223 aa  190  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  45.92 
 
 
230 aa  188  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  47.26 
 
 
247 aa  185  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  40.59 
 
 
216 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  40.59 
 
 
216 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  40.59 
 
 
216 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.1 
 
 
216 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.1 
 
 
216 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  40.59 
 
 
216 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  40.59 
 
 
216 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  41.33 
 
 
216 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  43.39 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  44.74 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  43.24 
 
 
230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  43.24 
 
 
230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  47.13 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  42.33 
 
 
233 aa  162  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  42.56 
 
 
269 aa  160  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  38.95 
 
 
208 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  38.81 
 
 
229 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  40.84 
 
 
246 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  37.89 
 
 
217 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  38.17 
 
 
267 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  37.95 
 
 
224 aa  138  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  34.95 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  34.95 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  36.92 
 
 
210 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  37.91 
 
 
212 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  38.71 
 
 
191 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  36.67 
 
 
223 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  36.65 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  36.65 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  36.65 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  35.83 
 
 
212 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  36.36 
 
 
212 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  35.83 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  35.83 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  35.83 
 
 
215 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  35.83 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  35.83 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  35.83 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  35.83 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  35.83 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  34.95 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  35.83 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  38.18 
 
 
226 aa  122  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  33.51 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  35.8 
 
 
203 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  36.54 
 
 
221 aa  99.8  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  33.09 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  33.86 
 
 
388 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  30.69 
 
 
814 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  27.57 
 
 
570 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3877  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.73 
 
 
742 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2116  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.98 
 
 
807 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0339196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0842  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.4 
 
 
817 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461248  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4687  GTP pyrophosphokinase  31.91 
 
 
729 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167199 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0617  ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3' pyrophosphohydrolase  30.29 
 
 
729 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2058  (p)ppGpp synthetase I  30.16 
 
 
786 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226647  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1408  RelA/SpoT family protein  28.32 
 
 
731 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0453  RelA/SpoT family protein  28.32 
 
 
723 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000671385  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1288  RelA/SpoT family protein  28.32 
 
 
723 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3149  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.52 
 
 
747 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439153  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2496  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.52 
 
 
747 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4366  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.21 
 
 
736 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6106  GTP diphosphokinase  30.64 
 
 
785 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364718  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1559  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.36 
 
 
746 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0645  GTP pyrophosphokinase (ATP:GTP 3'-pyrophosphotransferase)(ppGpp synthetase I) ((P)ppGpp synthetase)  27.96 
 
 
750 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0652  RelA/SpoT family protein  27.96 
 
 
750 aa  56.2  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1694  GTP pyrophosphokinase  31.85 
 
 
744 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3695  RelA/SpoT protein  31.85 
 
 
747 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120676  hitchhiker  0.00160014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3499  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  38.39 
 
 
701 aa  55.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2856  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  37.96 
 
 
749 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0013983  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1298  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  26.34 
 
 
740 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000189131  hitchhiker  0.0061753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.52 
 
 
747 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111478  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2445  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.11 
 
 
737 aa  55.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1098  GTP pyrophosphokinase  30.32 
 
 
745 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0204  GTP pyrophosphokinase  30.32 
 
 
745 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1887  GTP pyrophosphokinase  30.32 
 
 
716 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4217  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.48 
 
 
747 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1709  GTP diphosphokinase  30.32 
 
 
745 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2597  GTP pyrophosphokinase  30.72 
 
 
725 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  25.32 
 
 
381 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1542  GTP pyrophosphokinase  30.32 
 
 
745 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0960  GTP pyrophosphokinase  30.32 
 
 
745 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00215739  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0910  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.21 
 
 
726 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.746196  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2442  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.92 
 
 
730 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.224797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.33 
 
 
717 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>