60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  100 
 
 		 328 aa  654    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  45.28 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  41.44 
 
 		 273 aa  195  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  38.01 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  39.77 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  36.6 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  36.6 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  39.02 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  36.47 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  34.59 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  35.98 
 
 		 269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  35.71 
 
 		 269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  36.97 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  36.09 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  35.77 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  34.7 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  34.7 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  32.13 
 
 		 275 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  37.23 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  31.77 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  37.02 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  34.2 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  35.77 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  33.08 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  38.27 
 
 		 289 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  36.47 
 
 		 281 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  31.05 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  37.63 
 
 		 611 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  32.38 
 
 		 458 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  27.13 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  28.87 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  29.07 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  28.02 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  27.08 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0515  Cyanophycinase-like exopeptidase  32.08 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  28.5 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  27.62 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  31.58 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2919  cyanophycinase  28.36 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  30.66 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  29.95 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  30.22 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2319  peptidase S51, dipeptidase E  23.9 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  30.53 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  31.25 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  31.06 
 
 		 559 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1592  peptidase E  23.38 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  26.09 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1642  peptidase S51 dipeptidase E  23.3 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5501  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  29.17 
 
 		 229 aa  47  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2337  Cyanophycinase and related exopeptidase-like protein  32.89 
 
 		 598 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.704877  normal  0.140679 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1774  hypothetical protein  22.89 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1900  hypothetical protein  22.89 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000489032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1622  peptidase E  22.89 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1824  hypothetical protein  22.89 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1643  hypothetical protein  22.89 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1847  hypothetical protein  22.99 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2002  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  32.24 
 
 		 541 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.083735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1689  cyanophycinase-like protein  28.26 
 
 		 374 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2050  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  33.55 
 
 		 541 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338236  normal  0.0124574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>