More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  100 
 
 
908 aa  1838  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  48.08 
 
 
894 aa  818  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  39.44 
 
 
894 aa  650  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  41.15 
 
 
876 aa  710  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  39.11 
 
 
887 aa  635  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  45.18 
 
 
877 aa  723  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  42.54 
 
 
902 aa  675  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  41.62 
 
 
906 aa  640  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  47.37 
 
 
879 aa  721  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  45.06 
 
 
877 aa  721  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  43.78 
 
 
901 aa  659  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  44.51 
 
 
918 aa  699  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  42.95 
 
 
885 aa  664  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  40.58 
 
 
893 aa  662  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  41.79 
 
 
882 aa  671  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  61.85 
 
 
914 aa  1075  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  43.44 
 
 
900 aa  654  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  43.71 
 
 
939 aa  746  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  41.7 
 
 
895 aa  654  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  48.26 
 
 
910 aa  772  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  42.35 
 
 
879 aa  601  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  42.45 
 
 
871 aa  594  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  41.38 
 
 
856 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  39.8 
 
 
896 aa  588  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  41.99 
 
 
881 aa  588  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  42.81 
 
 
861 aa  582  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  42.81 
 
 
861 aa  581  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  41.99 
 
 
856 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  41.28 
 
 
875 aa  573  1e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  40.22 
 
 
857 aa  569  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  41.37 
 
 
865 aa  572  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.42292e-09 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  40.96 
 
 
855 aa  563  1e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  40.29 
 
 
858 aa  565  1e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  40.45 
 
 
890 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  39.64 
 
 
878 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  40.91 
 
 
856 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  42.16 
 
 
862 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  33.44 
 
 
874 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  41.31 
 
 
861 aa  545  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  40.34 
 
 
856 aa  544  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  33.22 
 
 
874 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  41.08 
 
 
855 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  41.08 
 
 
855 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  41 
 
 
872 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  40.45 
 
 
855 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  38.9 
 
 
883 aa  517  1e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  38.05 
 
 
886 aa  515  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  38.05 
 
 
886 aa  515  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  38.84 
 
 
743 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  37.69 
 
 
746 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  39.97 
 
 
748 aa  446  1e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  37.45 
 
 
727 aa  440  1e-122  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.02251e-09 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  36.91 
 
 
730 aa  441  1e-122  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  39.8 
 
 
755 aa  439  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  38.97 
 
 
722 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  38.17 
 
 
751 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  38.98 
 
 
744 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  37.53 
 
 
723 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  37.16 
 
 
723 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  37.07 
 
 
727 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  36.45 
 
 
730 aa  422  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  36.63 
 
 
741 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  34.04 
 
 
622 aa  241  6e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  31.21 
 
 
637 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.41 
 
 
636 aa  221  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  35.53 
 
 
664 aa  220  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  30.56 
 
 
560 aa  218  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  41.08 
 
 
576 aa  212  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  34.32 
 
 
538 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  32.02 
 
 
646 aa  190  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  37.53 
 
 
725 aa  183  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  35.67 
 
 
328 aa  183  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  31.75 
 
 
584 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.29 
 
 
778 aa  174  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.4 
 
 
778 aa  171  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  32.32 
 
 
427 aa  171  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.75 
 
 
647 aa  170  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  34.65 
 
 
757 aa  166  2e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  21.91 
 
 
741 aa  163  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.48446e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.66 
 
 
755 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.06 
 
 
755 aa  158  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  35.71 
 
 
569 aa  152  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 
1103 aa  152  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  34.38 
 
 
571 aa  150  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.94 
 
 
750 aa  149  2e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.8 
 
 
754 aa  149  2e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  34.27 
 
 
585 aa  148  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 
593 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  28.67 
 
 
573 aa  144  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  34.24 
 
 
579 aa  144  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
581 aa  143  1e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2607  hypothetical protein  30.18 
 
 
340 aa  142  2e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  39.3 
 
 
594 aa  142  2e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  34.35 
 
 
581 aa  142  4e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  26.88 
 
 
1086 aa  142  4e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2734  hypothetical protein  30.18 
 
 
340 aa  141  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
593 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  32.11 
 
 
597 aa  139  3e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
594 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
594 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>