141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12980 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1820  Formate--tetrahydrofolate ligase  65.3 
 
 		 565 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0766  formate--tetrahydrofolate ligase  63.22 
 
 		 576 aa  685    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1568  formate--tetrahydrofolate ligase  63.22 
 
 		 576 aa  684    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2519  formate--tetrahydrofolate ligase  63.05 
 
 		 573 aa  684    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12980  formate--tetrahydrofolate ligase  100 
 
 		 564 aa  1136    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0219  formate--tetrahydrofolate ligase  59.54 
 
 		 564 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0522  formate--tetrahydrofolate ligase  58.29 
 
 		 564 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.897337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2057  Formate--tetrahydrofolate ligase  53.44 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0816  Formate--tetrahydrofolate ligase  55.16 
 
 		 554 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0109  formate--tetrahydrofolate ligase  53.44 
 
 		 559 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1409  formate--tetrahydrofolate ligase  52.93 
 
 		 555 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000797787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1499  formate--tetrahydrofolate ligase  51.93 
 
 		 570 aa  573  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.441254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0149  formate--tetrahydrofolate ligase  51.95 
 
 		 556 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2399  formate-tetrahydrofolate ligase  51.69 
 
 		 556 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0129  formate--tetrahydrofolate ligase  51.15 
 
 		 567 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0231  Formate--tetrahydrofolate ligase  49.56 
 
 		 567 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20990  Formate-tetrahydrofolate ligase  51.87 
 
 		 556 aa  562  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0795  formate--tetrahydrofolate ligase  51.94 
 
 		 555 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00613459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0024  Formate--tetrahydrofolate ligase  52.45 
 
 		 572 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24910  Formate-tetrahydrofolate ligase  51.32 
 
 		 557 aa  552  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0083  Formate-tetrahydrofolate ligase  51.42 
 
 		 556 aa  554  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.784091  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1317  formate--tetrahydrofolate ligase  53.46 
 
 		 555 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1580  formate--tetrahydrofolate ligase  53.46 
 
 		 555 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0203021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3264  formate--tetrahydrofolate ligase  52.11 
 
 		 561 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0089  formate--tetrahydrofolate ligase  50.53 
 
 		 566 aa  551  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.985231  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2219  formate--tetrahydrofolate ligase  52.92 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.83616  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1052  formate--tetrahydrofolate ligase  50.98 
 
 		 556 aa  545  1e-154  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2815  formate--tetrahydrofolate ligase  51.68 
 
 		 559 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.90071  normal  0.0134554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1712  formate--tetrahydrofolate ligase  52.12 
 
 		 558 aa  547  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2864  Formate--tetrahydrofolate ligase  53.56 
 
 		 555 aa  542  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0118  formate--tetrahydrofolate ligase  51.24 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1009  formate-tetrahydrofolate ligase  50.27 
 
 		 560 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2298  formate--tetrahydrofolate ligase  50.53 
 
 		 559 aa  541  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0621  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.88 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.164812  normal  0.927809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3236  formate--tetrahydrofolate ligase  51.77 
 
 		 558 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.932652  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4459  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  52.12 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0477556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0414  formate--tetrahydrofolate ligase  52.04 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119816  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0447  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.86 
 
 		 557 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0018  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  48.58 
 
 		 556 aa  538  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1412  formate-tetrahydrofolate ligase  52.66 
 
 		 556 aa  531  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.749382  hitchhiker  0.00000422387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3083  formate--tetrahydrofolate ligase  51.75 
 
 		 559 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1275  formate--tetrahydrofolate ligase  52.5 
 
 		 560 aa  534  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0484  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.86 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3272  formate--tetrahydrofolate ligase  51.6 
 
 		 555 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2204  formate--tetrahydrofolate ligase  50.88 
 
 		 559 aa  531  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0555  formate--tetrahydrofolate ligase  49.65 
 
 		 558 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00600  Formate--tetrahydrofolate ligase  52.04 
 
 		 554 aa  531  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00136025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2125  Formate--tetrahydrofolate ligase  47.07 
 
 		 553 aa  528  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1283  formate--tetrahydrofolate ligase  50.89 
 
 		 555 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0499733  normal  0.578688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2752  formate--tetrahydrofolate ligase  48.76 
 
 		 556 aa  529  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00362383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2187  formate--tetrahydrofolate ligase  49.47 
 
 		 562 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0200027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1959  formate--tetrahydrofolate ligase  49.29 
 
 		 562 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1938  formate--tetrahydrofolate ligase  49.29 
 
 		 562 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1914  formate--tetrahydrofolate ligase  49.29 
 
 		 562 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.251904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2107  formate--tetrahydrofolate ligase  49.29 
 
 		 562 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2254  formate-tetrahydrofolate ligase  50.53 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000171666  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3197  formate--tetrahydrofolate ligase  49.65 
 
 		 562 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.780376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88119  tetrahydrofolate synthase  46.6 
 
 		 946 aa  525  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.226712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2141  formate--tetrahydrofolate ligase  49.29 
 
 		 562 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1787  formate--tetrahydrofolate ligase  48.59 
 
 		 555 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2105  Formate--tetrahydrofolate ligase  48.58 
 
 		 553 aa  527  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1822  formate--tetrahydrofolate ligase  48.59 
 
 		 555 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1593  formate--tetrahydrofolate ligase  48.94 
 
 		 583 aa  528  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2117  formate--tetrahydrofolate ligase  49.65 
 
 		 583 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.546563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1952  formate--tetrahydrofolate ligase  49.29 
 
 		 583 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0316175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4072  formate--tetrahydrofolate ligase  51.86 
 
 		 557 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000208  formate--tetrahydrofolate ligase  47.68 
 
 		 582 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1295  formate--tetrahydrofolate ligase  47.59 
 
 		 555 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.973248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2767  formate--tetrahydrofolate ligase  51.33 
 
 		 557 aa  522  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0163716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2201  formate--tetrahydrofolate ligase  49.12 
 
 		 562 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045703  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02998  C1 tetrahydrofolate synthase C1-THFS Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN8]  47.07 
 
 		 1031 aa  519  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0663  formate--tetrahydrofolate ligase  52.23 
 
 		 557 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4561  formate-tetrahydrofolate ligase  54.77 
 
 		 559 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2316  formate--tetrahydrofolate ligase  52.23 
 
 		 557 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0556  formate--tetrahydrofolate ligase  48.7 
 
 		 582 aa  519  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.124626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1654  formate--tetrahydrofolate ligase  51.68 
 
 		 555 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0498666 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0981  formate--tetrahydrofolate ligase  49.47 
 
 		 558 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.911463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2355  formate--tetrahydrofolate ligase  47.83 
 
 		 569 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05943  formate--tetrahydrofolate ligase  47.34 
 
 		 582 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0569  formate--tetrahydrofolate ligase  51.34 
 
 		 557 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2785  formate--tetrahydrofolate ligase  45.57 
 
 		 556 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2471  formate--tetrahydrofolate ligase  45.57 
 
 		 556 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02250  Formate-tetrahydrofolate ligase  53.56 
 
 		 555 aa  508  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00590  folic acid and derivative metabolism-related protein, putative  46.74 
 
 		 1021 aa  506  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2358  formate--tetrahydrofolate ligase  50.18 
 
 		 558 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269795  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1237  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  50.53 
 
 		 574 aa  504  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474316  hitchhiker  0.00654848 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1111  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.94 
 
 		 551 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.596432  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0269  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.09 
 
 		 551 aa  499  1e-140  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1007  formate--tetrahydrofolate ligase  45.12 
 
 		 555 aa  501  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0866489  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_80013  mitochondrial C1- tetrahydrofolate synthase precursor  44.79 
 
 		 995 aa  497  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.959666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0443  formate--tetrahydrofolate ligase  47.83 
 
 		 564 aa  495  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3720  formate--tetrahydrofolate ligase  47.3 
 
 		 570 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000981333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3185  Formate--tetrahydrofolate ligase  48.59 
 
 		 560 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1296  formate--tetrahydrofolate ligase  48.63 
 
 		 591 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49229  fomate-tetrahydrofolate ligase  47.17 
 
 		 666 aa  489  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167975  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0837  formate--tetrahydrofolate ligase  46.28 
 
 		 556 aa  491  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.21789  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28303  predicted protein  45.23 
 
 		 662 aa  488  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00317513  decreased coverage  0.000285759 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0640  formate--tetrahydrofolate ligase  46.64 
 
 		 605 aa  491  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0358  formate--tetrahydrofolate ligase  46.25 
 
 		 550 aa  489  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0792424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4339  formate--tetrahydrofolate ligase  47.83 
 
 		 570 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>