25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12800 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12800  Protein of unknown function (DUF2581)  100 
 
 
150 aa  292  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0224301  decreased coverage  0.00565206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2974  hypothetical protein  42.45 
 
 
162 aa  89.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26731  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1864  Protein of unknown function DUF2581  42.64 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0408425  normal  0.232813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18200  Protein of unknown function (DUF2581)  40.71 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3113  hypothetical protein  34.78 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272231  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2055  hypothetical protein  51.09 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1732  hypothetical protein  43.48 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0454052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2992  hypothetical protein  37.72 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.10835  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16060  Protein of unknown function (DUF2581)  32.19 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.199919  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0863  Protein of unknown function DUF2581  39.67 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17667  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2837  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36145  normal  0.0579285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1874  hypothetical protein  34.4 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1082  hypothetical protein  31.93 
 
 
156 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5216  hypothetical protein  34.15 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15750  Protein of unknown function (DUF2581)  34.06 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1376  hypothetical protein  31.3 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.486937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3717  hypothetical protein  40.51 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.668266  normal  0.103585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2696  hypothetical protein  31.36 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2453  hypothetical protein  32.29 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1881  hypothetical protein  32.58 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0884848  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2559  Protein of unknown function DUF2581  32.12 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11446  hypothetical protein  46.15 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0232943  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2433  hypothetical protein  34.57 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.504419  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2439  hypothetical protein  34.57 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2392  hypothetical protein  34.57 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>