More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12660 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
319 aa  636    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  60.59 
 
 
313 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.04 
 
 
323 aa  360  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.71 
 
 
309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.46 
 
 
323 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.59 
 
 
318 aa  353  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60 
 
 
315 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  59.61 
 
 
311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  59.6 
 
 
310 aa  351  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.74 
 
 
308 aa  349  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  60.39 
 
 
306 aa  349  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.03 
 
 
315 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.55 
 
 
319 aa  346  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.74 
 
 
328 aa  345  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.74 
 
 
308 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  60.68 
 
 
351 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  59.22 
 
 
312 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.06 
 
 
316 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.06 
 
 
316 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.06 
 
 
316 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  60 
 
 
316 aa  342  5e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  57.47 
 
 
302 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  58.06 
 
 
309 aa  341  8e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.6 
 
 
313 aa  341  9e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  59.43 
 
 
332 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.24 
 
 
324 aa  339  4e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  58.9 
 
 
310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  57.96 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  56.55 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  57.98 
 
 
327 aa  335  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  57.98 
 
 
335 aa  332  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.98 
 
 
337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.98 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  59.03 
 
 
311 aa  322  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  55.29 
 
 
333 aa  322  6e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  55.35 
 
 
320 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.72 
 
 
311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.9 
 
 
321 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  51.77 
 
 
326 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.42 
 
 
313 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
315 aa  295  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
315 aa  295  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
334 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
315 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.61 
 
 
317 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1299  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.4 
 
 
318 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0235362  hitchhiker  0.00573061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.79 
 
 
335 aa  289  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1391  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.09 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621598  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  52.44 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.94 
 
 
317 aa  288  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0839  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
321 aa  288  6e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.94 
 
 
317 aa  288  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0564  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.75 
 
 
322 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0599  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.75 
 
 
322 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.92 
 
 
315 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.94 
 
 
316 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  49.83 
 
 
313 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.26 
 
 
322 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.29 
 
 
316 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.35 
 
 
313 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.42 
 
 
316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.37 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.21 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2007  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.29 
 
 
362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0223  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.47 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.40055  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.78 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.98 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2555  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.04 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  48.72 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285295  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1002  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.14 
 
 
320 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  52.77 
 
 
319 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2662  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.14 
 
 
320 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3527  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.27 
 
 
317 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  47.88 
 
 
307 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
323 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2424  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.59 
 
 
317 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
323 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2247  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.94 
 
 
317 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.414785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  51.78 
 
 
329 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.21 
 
 
307 aa  279  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  46.58 
 
 
311 aa  279  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
323 aa  278  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  50.97 
 
 
314 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
316 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.15 
 
 
334 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3070  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
319 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.87496  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.95 
 
 
327 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
328 aa  276  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3059  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.95 
 
 
327 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
313 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0365  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.76 
 
 
324 aa  276  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1359  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.59 
 
 
319 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118486  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.21 
 
 
307 aa  276  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.91 
 
 
312 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  48.7 
 
 
309 aa  276  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.88 
 
 
313 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.39 
 
 
318 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
313 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>