More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12640 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  100 
 
 
137 aa  273  7e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  57.66 
 
 
138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  57.66 
 
 
136 aa  163  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  56.93 
 
 
138 aa  160  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  57.97 
 
 
136 aa  156  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  55.47 
 
 
138 aa  155  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  57.78 
 
 
150 aa  153  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  54.29 
 
 
139 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  53.68 
 
 
138 aa  151  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  52.55 
 
 
136 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  54.14 
 
 
144 aa  146  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  50 
 
 
138 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  52.21 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  48.23 
 
 
145 aa  136  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  49.63 
 
 
142 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  53.91 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  51.2 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  50 
 
 
153 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  49.61 
 
 
153 aa  130  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  51.15 
 
 
162 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  51.15 
 
 
162 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  51.15 
 
 
162 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  50.38 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  48.53 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  50.79 
 
 
135 aa  123  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  47.01 
 
 
136 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  50.38 
 
 
164 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  44.53 
 
 
144 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  47.01 
 
 
136 aa  120  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  43.51 
 
 
190 aa  117  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  45.32 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  45.04 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  43.38 
 
 
147 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  41.73 
 
 
160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  48.62 
 
 
135 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14710  transcription antitermination factor NusB  40.15 
 
 
178 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  42.75 
 
 
163 aa  100  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  51.61 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  40.77 
 
 
162 aa  95.5  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  40.77 
 
 
195 aa  94.7  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  34.06 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  34.11 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  33.59 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  35.38 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  36.43 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  35.34 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  35.88 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  37.01 
 
 
167 aa  84  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  36.36 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  32.82 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  44.79 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  31.58 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  29.85 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  32.33 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  30.23 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  32.82 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  34.33 
 
 
183 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  32.8 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  36.84 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  31.43 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  32.06 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  35 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  38.82 
 
 
142 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  37.1 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  33.08 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  34.92 
 
 
138 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  35.38 
 
 
133 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  33.08 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  30.15 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  31.58 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  36.59 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  34.96 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  44.19 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  31.01 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  31.78 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  37.65 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  36.92 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  30.37 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0424  NusB antitermination factor  41.67 
 
 
294 aa  73.6  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.518961  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  27.91 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  34.11 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  32.81 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  30.71 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  40.43 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  40 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  33.59 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  41.77 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0722  transcription termination factor  33.59 
 
 
325 aa  71.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  38.37 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  36 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>