More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12390 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12390  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 651 aa  1251    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00374737  normal  0.634901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  42.43 
 
 		 611 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  38.2 
 
 		 580 aa  313  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  40.59 
 
 		 583 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 612 aa  289  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  39.27 
 
 		 583 aa  286  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  37.94 
 
 		 579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  37.08 
 
 		 593 aa  273  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  38.19 
 
 		 590 aa  260  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  30.11 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  36.02 
 
 		 587 aa  243  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29.62 
 
 		 555 aa  234  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.27 
 
 		 560 aa  233  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  30.19 
 
 		 553 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  30.38 
 
 		 577 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  26.31 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  29.92 
 
 		 574 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  30.19 
 
 		 553 aa  231  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  30.24 
 
 		 553 aa  231  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  28.91 
 
 		 573 aa  231  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  30.19 
 
 		 553 aa  231  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  30.19 
 
 		 553 aa  230  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  30.19 
 
 		 553 aa  230  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  30.19 
 
 		 553 aa  230  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  30.03 
 
 		 553 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  30.28 
 
 		 553 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  31.28 
 
 		 556 aa  229  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  33.49 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  33.49 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  33.49 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  33.49 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  33.49 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  33.49 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  33.49 
 
 		 549 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  32.65 
 
 		 568 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  25.6 
 
 		 555 aa  224  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  25.2 
 
 		 555 aa  223  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  30.91 
 
 		 558 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  33.49 
 
 		 569 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  32.06 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  32.49 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  31.27 
 
 		 547 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  28.48 
 
 		 559 aa  219  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  25.7 
 
 		 567 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  28.33 
 
 		 561 aa  217  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  30.65 
 
 		 560 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  31.96 
 
 		 589 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  26.73 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  44.14 
 
 		 570 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  28.8 
 
 		 565 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  27.22 
 
 		 552 aa  208  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  31.09 
 
 		 599 aa  207  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  44.95 
 
 		 584 aa  207  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  33.49 
 
 		 523 aa  206  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  27.61 
 
 		 569 aa  206  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  52.96 
 
 		 575 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  24.38 
 
 		 570 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  30.03 
 
 		 563 aa  205  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  25.76 
 
 		 561 aa  204  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  28.3 
 
 		 552 aa  204  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  28.46 
 
 		 554 aa  204  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 		 554 aa  203  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  28.82 
 
 		 553 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  26.16 
 
 		 553 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  30.63 
 
 		 601 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  27.13 
 
 		 562 aa  201  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  28.92 
 
 		 587 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  28.57 
 
 		 552 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  27.82 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  29.69 
 
 		 586 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  30.82 
 
 		 576 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  40.79 
 
 		 584 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  41.69 
 
 		 585 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  30.88 
 
 		 553 aa  198  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  24.3 
 
 		 574 aa  198  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  27.37 
 
 		 588 aa  197  6e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  26.03 
 
 		 553 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  28.14 
 
 		 552 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  28.14 
 
 		 552 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  28.14 
 
 		 552 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  29.16 
 
 		 558 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  28.14 
 
 		 552 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  23.58 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  28.66 
 
 		 552 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  28.66 
 
 		 552 aa  194  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  26.53 
 
 		 560 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  26.11 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  50.21 
 
 		 567 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  31.6 
 
 		 557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  24.1 
 
 		 561 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  30.39 
 
 		 552 aa  188  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  30.52 
 
 		 555 aa  188  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  28.07 
 
 		 554 aa  188  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  27.53 
 
 		 556 aa  187  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  49.24 
 
 		 590 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  48.66 
 
 		 585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  28.93 
 
 		 549 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  54.94 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  44.88 
 
 		 574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>