More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12310 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12310  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  100 
 
 
270 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.3676  normal  0.223065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.24 
 
 
281 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.013763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.0467336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
273 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997342  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
272 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.25903 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
260 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.56 
 
 
236 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
244 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
239 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
237 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3848  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
256 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
238 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
239 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0343  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 
314 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25000  short-chain alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.28 
 
 
238 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19521  normal  0.023029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
241 aa  95.9  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
238 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
262 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
237 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000512545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  27.75 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  32.45 
 
 
243 aa  92.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
262 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
247 aa  92.4  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.36 
 
 
238 aa  92  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
243 aa  92  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
264 aa  92  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 
258 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2123  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.34 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.35 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.35 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.9 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.31 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  33.01 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0422  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  29.66 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  29.9 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
258 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0649  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  29.49 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 
276 aa  89.4  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.47 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 
337 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 
262 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.38 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.38 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
253 aa  89  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
249 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
282 aa  89  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.451543 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  31.66 
 
 
258 aa  88.6  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
251 aa  88.6  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>