182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11840 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1532  glycyl-tRNA synthetase  71.15 
 
 
461 aa  709  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.605257  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 
468 aa  973  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  70.51 
 
 
468 aa  709  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3369  glycyl-tRNA synthetase  68.16 
 
 
462 aa  676  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.0704929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  69.68 
 
 
461 aa  692  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  67.97 
 
 
506 aa  675  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  70.94 
 
 
462 aa  708  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  71.37 
 
 
466 aa  701  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  69.18 
 
 
463 aa  693  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3224  glycyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 
462 aa  687  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0778215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12383  glycyl-tRNA synthetase  66.88 
 
 
463 aa  657  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  73.25 
 
 
471 aa  743  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  69.85 
 
 
460 aa  694  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  70.3 
 
 
462 aa  698  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  70.3 
 
 
468 aa  710  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  68.66 
 
 
463 aa  694  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  72.01 
 
 
461 aa  715  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3146  glycyl-tRNA synthetase  69.59 
 
 
463 aa  681  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  70.51 
 
 
468 aa  709  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  70.3 
 
 
468 aa  708  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  73.29 
 
 
461 aa  719  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.3951e-12 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  67.68 
 
 
490 aa  666  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
462 aa  680  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  67.31 
 
 
461 aa  677  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3810  glycyl-tRNA synthetase  70.07 
 
 
459 aa  692  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06090  glycyl-tRNA synthetase  67.67 
 
 
460 aa  669  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  72.26 
 
 
478 aa  729  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  69.4 
 
 
467 aa  697  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  72.22 
 
 
462 aa  716  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0798  glycyl-tRNA synthetase  64.32 
 
 
465 aa  649  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.511892  normal  0.155631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 
461 aa  685  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  72.67 
 
 
467 aa  711  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3433  glycyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 
459 aa  687  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  66.24 
 
 
462 aa  679  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2058  glycyl-tRNA synthetase  70.07 
 
 
461 aa  687  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  67.25 
 
 
460 aa  653  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
466 aa  528  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 
457 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
434 aa  506  1e-142  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.9424e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 
467 aa  508  1e-142  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 
467 aa  508  1e-142  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
460 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  5.03575e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
462 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.02075e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
458 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
443 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
458 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
458 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
458 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
458 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
445 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
458 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
458 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 
458 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
458 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
458 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 
458 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
433 aa  487  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
464 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
456 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
460 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
448 aa  474  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
463 aa  471  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
463 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
463 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
462 aa  466  1e-130  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1000  glycyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
509 aa  466  1e-130  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.450604  hitchhiker  0.00350123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
462 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
462 aa  453  1e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
451 aa  451  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0023  glycyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
489 aa  440  1e-122  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0017  glycyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
489 aa  438  1e-122  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0024  glycyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
488 aa  441  1e-122  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.757041 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
473 aa  439  1e-122  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0024  glycyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
488 aa  439  1e-122  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00479834  normal  0.0124989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
481 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0036  glycyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
489 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.479025  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
445 aa  437  1e-121  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0030  glycyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
491 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0045  glycyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
489 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
451 aa  428  1e-118  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  8.7846e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  42.16 
 
 
602 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
459 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
551 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
458 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2165  glycyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
515 aa  411  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1774  glycyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
525 aa  409  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.360257  normal  0.456837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0411  glycyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
476 aa  405  1e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
456 aa  405  1e-112  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
495 aa  407  1e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0796  glycyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
513 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
508 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
504 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
507 aa  396  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01740  glycyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
511 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
494 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1379  glycyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
516 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0361  glycyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
496 aa  385  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3489  glycyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
504 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
502 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
497 aa  381  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>