More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11800 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 129 aa  263  5e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  55.56 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  55.12 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  56.8 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  56.8 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  56.8 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  55.04 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  52.14 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  49.61 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  50.82 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  52.42 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  51.16 
 
 		 134 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  51.18 
 
 		 175 aa  135  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  52.85 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  52.46 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  50.4 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  49.19 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  46.77 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  50.82 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  50.39 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  54.24 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  51.22 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  49.19 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  47.29 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  47.29 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  46.56 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  46.56 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  47.62 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  49.19 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  50.41 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  48.78 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  49.19 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  48.82 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  45.97 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  42.28 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  43.2 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  34.92 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  32.82 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  35.54 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 		 143 aa  84.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  36.22 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  32.03 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  32.03 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  32.03 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  36.8 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  36.8 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  37.98 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  35.2 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  36.51 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  36.51 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  38.1 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  36.51 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  31.01 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  32.8 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  33.6 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  32.8 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  31.5 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  31.2 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  32 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  32 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  37.21 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  37.21 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  32 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  32 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  32 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  32 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  35.38 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  35.77 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  32.8 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  32 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  33.33 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  32.8 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  30.23 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>