More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11520 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11520  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 423 aa  832    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0049464  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  47.65 
 
 		 413 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  44.78 
 
 		 365 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  41.04 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  46.09 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  44.24 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  43.43 
 
 		 411 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  40.7 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  42.66 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  40.27 
 
 		 390 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  41.4 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  38.35 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  34.75 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  41.23 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  39.63 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0674  cell cycle protein  35.26 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.935594  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  36.63 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  34.93 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  37.2 
 
 		 374 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  42.29 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  38.34 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  36.62 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  38.32 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  38.67 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  40.88 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  35.39 
 
 		 376 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  34.69 
 
 		 382 aa  202  9e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  33.5 
 
 		 426 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.07 
 
 		 373 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  36.52 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  33.42 
 
 		 417 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  34.43 
 
 		 371 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 368 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  36.52 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  34.06 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 		 371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  36.07 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.46 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  37.57 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  38.87 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.28 
 
 		 371 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  37.54 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  37.19 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  38.27 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  37.21 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  35.77 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  37.61 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  37.84 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  35.52 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  38.83 
 
 		 382 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.68 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  38.3 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 367 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 367 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  32.8 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.13 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  37.19 
 
 		 373 aa  192  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0703  cell cycle protein FtsW  34.2 
 
 		 407 aa  192  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  35.61 
 
 		 363 aa  192  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  36.05 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  35.93 
 
 		 360 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  34.53 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  35.76 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  38.33 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  35.68 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  38.33 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  39.18 
 
 		 362 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.57 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  35.49 
 
 		 384 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  36.75 
 
 		 385 aa  190  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  38.87 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  36.19 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33.82 
 
 		 417 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33.82 
 
 		 417 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 407 aa  189  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 366 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  35.18 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  36.48 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  32.07 
 
 		 360 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  36.56 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  38.1 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  38.57 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  38.97 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  40.39 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  33.33 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.1 
 
 		 378 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>