More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11220 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  74.46 
 
 		 185 aa  290  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  72.22 
 
 		 185 aa  278  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  71.2 
 
 		 185 aa  272  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  70.11 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  67.39 
 
 		 185 aa  264  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  64.67 
 
 		 185 aa  259  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  70.65 
 
 		 185 aa  257  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  66.3 
 
 		 185 aa  254  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  65.76 
 
 		 185 aa  254  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  62.5 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  61.96 
 
 		 185 aa  245  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  62.5 
 
 		 185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  61.96 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  58.7 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  58.15 
 
 		 185 aa  242  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  60.33 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  59.78 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  64.41 
 
 		 188 aa  236  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  59.78 
 
 		 185 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  58.7 
 
 		 185 aa  232  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  57.61 
 
 		 185 aa  230  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  57.61 
 
 		 185 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  58.7 
 
 		 185 aa  227  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  224  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  56.74 
 
 		 184 aa  218  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  217  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  217  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  54.89 
 
 		 185 aa  217  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 185 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  56.18 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  58.7 
 
 		 185 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  51.61 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  48.94 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  48.92 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  52 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  48.39 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  47.75 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  46.77 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 184 aa  181  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  46.24 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  45.7 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  45.16 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  43.55 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 182 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  46.67 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  44.62 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  46.07 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 187 aa  174  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  174  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1801  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0761482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  43.75 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1713  ribosome recycling factor  46.07 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.634528  normal  0.959645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>