More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11170 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  100 
 
 		 336 aa  652    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  51.83 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  45 
 
 		 355 aa  272  6e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  49.85 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  48.13 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  48.5 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  48.15 
 
 		 292 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  46.18 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  51.06 
 
 		 380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  48.04 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  48.64 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.81 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.26 
 
 		 300 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.26 
 
 		 300 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.26 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  48.63 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  50 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.7 
 
 		 300 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  46.15 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  47.29 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  48.05 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  47.46 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.09 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.85 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  47.4 
 
 		 289 aa  235  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.3 
 
 		 303 aa  235  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  46.11 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  46.67 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  47.4 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  37.05 
 
 		 298 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  49.39 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3995  integrase family protein  48.92 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  46.44 
 
 		 363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  33.43 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  34.45 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  39.83 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  34.15 
 
 		 307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  33.54 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  38.03 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  38.11 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  38.99 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.74 
 
 		 296 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 296 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 296 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 296 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 		 296 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  39.29 
 
 		 294 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  33.53 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  37.94 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.65 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  33.44 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  33.44 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  35.14 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  36.39 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  34.24 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  46.39 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  37 
 
 		 317 aa  198  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  37.61 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  35.82 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  34.13 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  38.99 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  38.41 
 
 		 304 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.42 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  33.53 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  33.53 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.04 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  35.37 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.7 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  36.14 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.11 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  38.11 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  32.21 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.74 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  37.54 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.74 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.14 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.65 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  35.65 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.04 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.14 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  34.55 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  33.63 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  38.89 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.82 
 
 		 300 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  35.93 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  31.17 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  31.5 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.74 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.74 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.74 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.85 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.74 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  41.07 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>