81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10330 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10330  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 286 aa  550  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1236  Type II secretion system F domain protein  55.24 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.952189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2407  type II secretion system protein  52.6 
 
 		 285 aa  266  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2672  type II secretion system protein  52.78 
 
 		 284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20410  Flp pilus assembly protein TadB  51.82 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5825  type II secretion system protein  55.97 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2790  type II secretion system protein  52.45 
 
 		 285 aa  244  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.720201  hitchhiker  0.0010112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1210  Type II secretion system F domain protein  50.19 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0780  type II secretion system protein  57.14 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1650  type II secretion system protein  49.4 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0624732  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1253  type II secretion system protein  51.11 
 
 		 284 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1032  type II secretion system protein  54.51 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07510  Flp pilus assembly protein TadB  51.69 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1738  type II secretion system protein  58.67 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0857  type II secretion system protein  46.67 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3788  type II secretion system protein  49.44 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  25 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  22.43 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  28.63 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  27.31 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.77 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  28.91 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  26.5 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  27.27 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  27.96 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  24.07 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  24.26 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4645  type II secretion system protein  28.91 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  23.61 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  30.17 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 324 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  23.61 
 
 		 325 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 335 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  24.16 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  24.37 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  25.27 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  26.05 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  23.3 
 
 		 332 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  23.88 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4969  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  29.31 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  23.35 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4456  type II secretion system protein  25.84 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.138115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  24.3 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.35 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  24.87 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  25.17 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  35 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  21.72 
 
 		 337 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  28.04 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  22.46 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25.49 
 
 		 321 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.44 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  27.6 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  27.78 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  22.38 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  24.63 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  22.61 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  28.77 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  28.57 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  27.82 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 660 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  26 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  22.16 
 
 		 336 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>