More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10130 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
308 aa  615  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  67.87 
 
 
306 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  61.31 
 
 
315 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  60.45 
 
 
330 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 
308 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  58.77 
 
 
311 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  60.46 
 
 
322 aa  361  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  58.96 
 
 
307 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 
323 aa  358  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  62.13 
 
 
306 aa  355  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  58.47 
 
 
338 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  58.77 
 
 
310 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  55.23 
 
 
307 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 
327 aa  345  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  58.2 
 
 
312 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
307 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  55.34 
 
 
335 aa  342  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 
307 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  57.28 
 
 
310 aa  342  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  56.54 
 
 
310 aa  342  5.999999999999999e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 
307 aa  340  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  60.71 
 
 
314 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  57.57 
 
 
319 aa  337  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  54.69 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  55.56 
 
 
307 aa  334  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  56.13 
 
 
309 aa  332  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  58.01 
 
 
314 aa  328  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  53.92 
 
 
307 aa  328  8e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  54.1 
 
 
310 aa  319  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 
312 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  54.75 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
340 aa  289  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 
312 aa  276  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
309 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
319 aa  265  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
355 aa  263  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
309 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 
311 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 
311 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  42.66 
 
 
305 aa  258  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 
309 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
315 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  45.25 
 
 
303 aa  256  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 
302 aa  255  8e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  44.87 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  42.28 
 
 
309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  42.12 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  40.72 
 
 
307 aa  252  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  40.33 
 
 
304 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  41.67 
 
 
320 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
309 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  43.93 
 
 
305 aa  250  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
309 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  43.27 
 
 
313 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  42.9 
 
 
314 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
306 aa  249  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  44.34 
 
 
303 aa  249  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  41.1 
 
 
306 aa  248  6e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  40.86 
 
 
338 aa  246  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  43.09 
 
 
301 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  43.81 
 
 
306 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
305 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
303 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  41.75 
 
 
312 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  43.19 
 
 
298 aa  245  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  42.48 
 
 
309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  43.58 
 
 
304 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  42.76 
 
 
303 aa  242  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  39.34 
 
 
316 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  39.93 
 
 
316 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  38.44 
 
 
304 aa  241  7.999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  39.47 
 
 
316 aa  241  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  42.81 
 
 
303 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  41.12 
 
 
309 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 
300 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  39.67 
 
 
316 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  39.34 
 
 
316 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  39.02 
 
 
316 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  42.91 
 
 
304 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  39.02 
 
 
316 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  45.77 
 
 
311 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  39.02 
 
 
316 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  41.31 
 
 
329 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 
319 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 
305 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  41.97 
 
 
303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0157  ornithine carbamoyltransferase  39.74 
 
 
304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  43 
 
 
305 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  39.02 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
312 aa  239  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  41.25 
 
 
310 aa  238  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 
305 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  40.79 
 
 
311 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  39.8 
 
 
301 aa  238  9e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  41.5 
 
 
323 aa  238  9e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>