92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  100 
 
 		 106 aa  203  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  46 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  43.75 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  47.31 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  43.75 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  43.16 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  40.21 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  43.9 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  46.74 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 97 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  35.37 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  39.74 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  39.13 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  35.85 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  36.96 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  34.34 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  42.11 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  37 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  37.63 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  36.56 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  36.08 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  38.04 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  39.13 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  39.47 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2359  DNA polymerase beta domain protein region  47.54 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  36.96 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  39.51 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  33.77 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  35.16 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  32.97 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  29.41 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  34.25 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  39.68 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  42.42 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  34.83 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  37.88 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  34.12 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  46.15 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  28.87 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  30.93 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  35.21 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  35.37 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  29.59 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.45 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.45 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  35.48 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  30 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  29.03 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  36.51 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  36.47 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  32.94 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 121 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  28.95 
 
 		 104 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  35.16 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  31.25 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  28.09 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  29.69 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  35.82 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  31.25 
 
 		 105 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  32.93 
 
 		 97 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>