209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09750 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  100 
 
 		 494 aa  965    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  58.68 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  42.62 
 
 		 485 aa  147  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  51.92 
 
 		 561 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  45.74 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 546 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  29.02 
 
 		 432 aa  117  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  37.5 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  27.44 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  38.61 
 
 		 407 aa  110  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  51.06 
 
 		 627 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  35.82 
 
 		 661 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  42.86 
 
 		 572 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  42.15 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  45.69 
 
 		 441 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  34.03 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  50.52 
 
 		 391 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  28.74 
 
 		 414 aa  96.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  33.57 
 
 		 526 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  29.01 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  47.47 
 
 		 255 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  29.05 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  32.73 
 
 		 505 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  31.42 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  31.42 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  32.74 
 
 		 435 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  32.74 
 
 		 435 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  29.93 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  31.58 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  28.79 
 
 		 620 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  31.42 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  29.25 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  39.69 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  28.11 
 
 		 538 aa  84.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  36.31 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  28.74 
 
 		 577 aa  83.6  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  32.29 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 526 aa  83.2  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  36.67 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  31.56 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  31.02 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  33.86 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  36.36 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  38.83 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  40.78 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  39.09 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  39.09 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  36.36 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  39.81 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  39.81 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  39.81 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  39.81 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  38.18 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  38.18 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  38.18 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  36.13 
 
 		 458 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  45.45 
 
 		 540 aa  75.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  31.72 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  38.6 
 
 		 580 aa  73.6  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  37.86 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  36.17 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  38.89 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  37.38 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  43.84 
 
 		 620 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  43.84 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  40.98 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  43.84 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  43.9 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  42.68 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21450  hypothetical protein  34.88 
 
 		 384 aa  69.7  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000664219  hitchhiker  0.0000176037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  37.19 
 
 		 222 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  44.74 
 
 		 531 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  51.47 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  42.47 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  30.84 
 
 		 593 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  39.56 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  39.62 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  35.94 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  33.58 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  39.76 
 
 		 451 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  47.06 
 
 		 518 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  47.06 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  35.9 
 
 		 519 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  36.56 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  43.59 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  38.68 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  38.68 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  38.68 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  38.68 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  38.68 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  42.86 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  38.68 
 
 		 507 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  36.56 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  50 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  36.56 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  38.61 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>