175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09510 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  100 
 
 		 464 aa  915    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  58.68 
 
 		 494 aa  465  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  40 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  29.17 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  28.44 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  50.48 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  38.92 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  45.31 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  37.72 
 
 		 413 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  51.02 
 
 		 414 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  51.43 
 
 		 255 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  52.04 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  52.81 
 
 		 469 aa  99.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  52.81 
 
 		 627 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 546 aa  99  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  28.23 
 
 		 561 aa  99  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  33.1 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  47.73 
 
 		 572 aa  94  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  37.5 
 
 		 661 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  44.8 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  32.95 
 
 		 526 aa  90.1  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  31.58 
 
 		 535 aa  90.1  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  32.88 
 
 		 418 aa  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  31.98 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  31.67 
 
 		 418 aa  87.8  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  34.64 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  31.74 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  44.23 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  44.23 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  42.31 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  34.51 
 
 		 538 aa  78.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  38.74 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  42.31 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  44.23 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  31.31 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  32.88 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21450  hypothetical protein  37.4 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000664219  hitchhiker  0.0000176037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  42.31 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  32.31 
 
 		 540 aa  75.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  28.68 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  28.68 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  42.31 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  31.28 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  42.31 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  44.44 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  42.31 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  31.72 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  41.35 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  41.35 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  41.35 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  41.35 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  41.51 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  41.51 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  30.77 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  38.21 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  41.51 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  30.77 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  40 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  30.77 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  39.36 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  40 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  30.33 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  30.77 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  30.33 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  40 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  39.42 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  40 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  40.7 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  30.14 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  30.33 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  45.57 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  30.5 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  30.5 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  41.51 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  29.86 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  29.47 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  39.8 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  29.86 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  36.59 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  43.42 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  31.55 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  35.45 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  31.86 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  38.74 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  30.48 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  41.56 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  41.56 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  41.56 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  39.08 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  40.26 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  39.08 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  39.08 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  39.08 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  39.08 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  39.08 
 
 		 507 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  39.08 
 
 		 507 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>