More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08440 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08440  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  799    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.231358  normal  0.194083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  76.36 
 
 
385 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  76.36 
 
 
384 aa  600  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1549  butyryl-CoA dehydrogenase  73.25 
 
 
387 aa  592  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.431805  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.43 
 
 
389 aa  554  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.8 
 
 
387 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.189497  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.02 
 
 
387 aa  545  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.57 
 
 
391 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.89 
 
 
390 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.89 
 
 
390 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1390  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.13 
 
 
390 aa  524  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.96 
 
 
389 aa  524  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.97 
 
 
387 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.82 
 
 
388 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  70.03 
 
 
387 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  67.45 
 
 
382 aa  510  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.93 
 
 
386 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.27 
 
 
387 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1058  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.54 
 
 
386 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.405365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.71 
 
 
387 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.58 
 
 
385 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  65.27 
 
 
417 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.92 
 
 
389 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13303  acyl-CoA dehydrogenase fadE25  65.54 
 
 
389 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1300  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  65.18 
 
 
388 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1336  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.18 
 
 
388 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0409  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.02 
 
 
406 aa  484  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1317  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.18 
 
 
388 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.32 
 
 
404 aa  385  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.72 
 
 
379 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.19 
 
 
380 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
379 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
379 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
379 aa  362  6e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
379 aa  362  9e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  49.34 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
379 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  49.87 
 
 
379 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
379 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  49.08 
 
 
379 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.42 
 
 
379 aa  358  9e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.44 
 
 
384 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.79 
 
 
381 aa  348  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  47.14 
 
 
379 aa  347  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.95 
 
 
379 aa  346  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.68 
 
 
382 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  45.6 
 
 
379 aa  338  7e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  45.6 
 
 
379 aa  338  7e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.19 
 
 
380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.68 
 
 
381 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.52 
 
 
389 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.44 
 
 
379 aa  333  4e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  45.79 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.26 
 
 
386 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
379 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.13 
 
 
379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.14 
 
 
380 aa  319  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  44.74 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.97 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1483  butyryl-CoA dehydrogenase  44.59 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3575  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.95 
 
 
380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3307  Acyl-CoA dehydrogenase-like  42.45 
 
 
380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3365  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.26 
 
 
381 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.1 
 
 
641 aa  302  8.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.57 
 
 
379 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.3 
 
 
380 aa  299  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3306  Acyl-CoA dehydrogenase-like  43.88 
 
 
380 aa  299  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0298  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.32 
 
 
381 aa  299  5e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.7 
 
 
389 aa  299  6e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  42.89 
 
 
378 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3053  Acyl-CoA dehydrogenase  41.21 
 
 
381 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.82 
 
 
383 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.18 
 
 
379 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.67 
 
 
389 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.73 
 
 
642 aa  296  4e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1659  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.53 
 
 
390 aa  296  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.41 
 
 
377 aa  295  9e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0762  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.58 
 
 
381 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  0.783766 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  42.55 
 
 
376 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  42.55 
 
 
376 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  42.55 
 
 
376 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  42.55 
 
 
381 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  42.55 
 
 
381 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  42.55 
 
 
376 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  42.55 
 
 
376 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  42.55 
 
 
376 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.99 
 
 
377 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.99 
 
 
377 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  43.49 
 
 
380 aa  292  8e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  42.02 
 
 
381 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5850  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  42.55 
 
 
380 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.29 
 
 
376 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  42.89 
 
 
378 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  40.68 
 
 
381 aa  289  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  40.68 
 
 
381 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1242  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.35 
 
 
379 aa  289  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.176039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  40.68 
 
 
381 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.51 
 
 
383 aa  288  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.42 
 
 
381 aa  288  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.29 
 
 
376 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>