More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08270 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 596 aa  1172    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  38.78 
 
 		 578 aa  313  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 590 aa  292  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 604 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 590 aa  256  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  43.75 
 
 		 604 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  37.2 
 
 		 615 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  37.68 
 
 		 619 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  33.8 
 
 		 611 aa  223  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 		 626 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  33.93 
 
 		 603 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  34.08 
 
 		 621 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  45.59 
 
 		 609 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  45.45 
 
 		 623 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.86 
 
 		 603 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  42.2 
 
 		 619 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  28.81 
 
 		 597 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  31.46 
 
 		 625 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  39.11 
 
 		 626 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  34.23 
 
 		 625 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  45.1 
 
 		 615 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  46.76 
 
 		 662 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  41.37 
 
 		 618 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  29.58 
 
 		 613 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  41.96 
 
 		 618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  41.89 
 
 		 623 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  47.06 
 
 		 638 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  41.54 
 
 		 627 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  41.67 
 
 		 618 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 616 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 616 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  25.42 
 
 		 618 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  32.77 
 
 		 611 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 623 aa  198  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.61 
 
 		 580 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  44.83 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  38.73 
 
 		 605 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.06 
 
 		 600 aa  193  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.44 
 
 		 598 aa  193  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  35.52 
 
 		 608 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 613 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  34.13 
 
 		 618 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  33.41 
 
 		 614 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  34.28 
 
 		 606 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.07 
 
 		 583 aa  190  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 608 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  34.03 
 
 		 626 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.93 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  37.08 
 
 		 592 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  37.1 
 
 		 594 aa  188  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  30.77 
 
 		 618 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  39.32 
 
 		 631 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  38.51 
 
 		 652 aa  187  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  32.34 
 
 		 595 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  36.71 
 
 		 611 aa  186  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  36.3 
 
 		 611 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  44.53 
 
 		 746 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 		 621 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  35.49 
 
 		 594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  29.96 
 
 		 619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  42.18 
 
 		 606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  44.87 
 
 		 621 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  33.33 
 
 		 568 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  44.87 
 
 		 621 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.5 
 
 		 639 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  43.8 
 
 		 626 aa  183  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  34.42 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 		 603 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.06 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.07 
 
 		 567 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  41.2 
 
 		 665 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.23 
 
 		 641 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 		 603 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  33.77 
 
 		 582 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  34.23 
 
 		 586 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  32.04 
 
 		 633 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.34 
 
 		 590 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  40.38 
 
 		 607 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  29.75 
 
 		 619 aa  181  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.07 
 
 		 567 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  34.22 
 
 		 975 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.48 
 
 		 590 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  34.44 
 
 		 565 aa  180  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.74 
 
 		 1013 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  30.92 
 
 		 603 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.12 
 
 		 598 aa  180  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.84 
 
 		 619 aa  180  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  45.66 
 
 		 590 aa  180  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 594 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38642  predicted protein  32.88 
 
 		 587 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.429359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  34.72 
 
 		 611 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 		 567 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  34.86 
 
 		 611 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  35.09 
 
 		 651 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  29.72 
 
 		 584 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  33.55 
 
 		 582 aa  179  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  32.86 
 
 		 644 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  41.63 
 
 		 647 aa  178  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  38.29 
 
 		 673 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.89 
 
 		 590 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>