More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08110 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  44.15 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  41.15 
 
 		 234 aa  131  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
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NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 218 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3878  transcriptional regulator, TetR family  43.15 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0990278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 187 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 221 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 209 aa  91.3  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  37.08 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 175 aa  88.6  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 192 aa  87.8  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  42.04 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 186 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  35.39 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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