233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07650 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07650  YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 
461 aa  938    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.446575  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  49.57 
 
 
408 aa  318  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.92 
 
 
575 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.12 
 
 
689 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  28.51 
 
 
580 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.64 
 
 
366 aa  96.3  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  29.75 
 
 
391 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.96 
 
 
406 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  28.18 
 
 
1667 aa  89.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29 
 
 
517 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.04 
 
 
1170 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  30.6 
 
 
819 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28 
 
 
312 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  28.8 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.5 
 
 
325 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.8 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.41 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  26.61 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.51 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.95 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.95 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.95 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.96 
 
 
810 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.15 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.95 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  27.9 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.15 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.71 
 
 
1094 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  27.56 
 
 
335 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.31 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.48 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
776 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.93 
 
 
348 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.13 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.45 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.16 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  27.6 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.71 
 
 
652 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.4 
 
 
971 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.4 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.51 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.64 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.21 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.17 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.05 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.11 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.9 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 
354 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  25.19 
 
 
556 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.78 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.45 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.88 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.32 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.23 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  29.68 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.87 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.51 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.8 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.93 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.89 
 
 
327 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1477  hypothetical protein  28.43 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.28 
 
 
336 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.8 
 
 
331 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4611  hypothetical protein  28.43 
 
 
346 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.87 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.87 
 
 
311 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.47 
 
 
311 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.11 
 
 
362 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.11 
 
 
362 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.11 
 
 
362 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.86 
 
 
330 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.35 
 
 
752 aa  63.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  25.35 
 
 
329 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.14 
 
 
332 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1486  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.78 
 
 
337 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814871  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.67 
 
 
326 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  26.52 
 
 
1189 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.58 
 
 
328 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5421  WD-40 repeat-containing protein  26.09 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.7 
 
 
328 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.05 
 
 
818 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.77 
 
 
323 aa  61.6  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.09 
 
 
344 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.37 
 
 
318 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.56 
 
 
488 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  28.96 
 
 
312 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  25 
 
 
445 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.11 
 
 
299 aa  60.1  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.9 
 
 
345 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.24 
 
 
310 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25 
 
 
451 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.52 
 
 
329 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3472  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.24 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.7 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.26 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.84 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.74 
 
 
327 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.7 
 
 
320 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.69 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>