More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07210 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 		 621 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  47.44 
 
 		 452 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 417 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 433 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  42.86 
 
 		 388 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  42.79 
 
 		 433 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.76 
 
 		 395 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 624 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.4 
 
 		 405 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.4 
 
 		 403 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  42.58 
 
 		 420 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 444 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  42.86 
 
 		 442 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 417 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 461 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  41.9 
 
 		 463 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 586 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 418 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  39.25 
 
 		 489 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 466 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  40.54 
 
 		 383 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  43.78 
 
 		 463 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  40.09 
 
 		 430 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 587 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  42.86 
 
 		 429 aa  121  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  40.74 
 
 		 476 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 435 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  44.5 
 
 		 434 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  42.72 
 
 		 416 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 492 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  43.78 
 
 		 412 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  41.71 
 
 		 429 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  44.04 
 
 		 374 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 725 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  40.48 
 
 		 402 aa  118  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.17 
 
 		 386 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 375 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 445 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 435 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 435 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 435 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  39.71 
 
 		 429 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.19 
 
 		 508 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  45.83 
 
 		 365 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  43.78 
 
 		 434 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 445 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  37.5 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 570 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.9 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 326 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 343 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 428 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  40 
 
 		 410 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 411 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 408 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  41.21 
 
 		 439 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 444 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 438 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  37.55 
 
 		 438 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  39.02 
 
 		 580 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  38.76 
 
 		 419 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 388 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 454 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  41.01 
 
 		 410 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  39.05 
 
 		 426 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 408 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  34.07 
 
 		 453 aa  98.2  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  40 
 
 		 446 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 432 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 		 447 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  39.91 
 
 		 389 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.32 
 
 		 415 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 422 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  36.32 
 
 		 405 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 465 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 431 aa  93.2  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 470 aa  93.2  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 470 aa  93.2  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  32.39 
 
 		 338 aa  92  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 576 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  37.5 
 
 		 395 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  35.37 
 
 		 664 aa  88.6  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 480 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 480 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  34.6 
 
 		 460 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 535 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 459 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 565 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 459 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  30.17 
 
 		 287 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  35.87 
 
 		 462 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 594 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  31.55 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  27.76 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1550  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 709 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>