More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07170 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.8 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.54 
 
 		 293 aa  308  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  60.98 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  61.2 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  63.24 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  64.37 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  60.24 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  59.84 
 
 		 249 aa  284  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  57.09 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.68 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  54.98 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  58.63 
 
 		 254 aa  277  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  52.59 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  53.23 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  58.91 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  56.75 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  62.15 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  53.75 
 
 		 266 aa  255  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  44.19 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  49.8 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  50.6 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  50.6 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.34 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.2 
 
 		 279 aa  178  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  39.06 
 
 		 247 aa  178  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.34 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.35 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 		 327 aa  176  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  37.77 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  40.09 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.1 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  40.27 
 
 		 337 aa  175  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  38.96 
 
 		 249 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.48 
 
 		 259 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1004  ABC transporter related  37.13 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00470286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.84 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 		 248 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  40.34 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 244 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  35.42 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 241 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 241 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  35.42 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.71 
 
 		 337 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  41.18 
 
 		 331 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36.64 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.53 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  38.53 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  40.27 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  35.45 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 		 321 aa  166  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  35 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  36.91 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  39.63 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  36.91 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  40 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  40.19 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  39.91 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 		 312 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 312 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 312 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 		 312 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  42.27 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  37.23 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  38.84 
 
 		 332 aa  165  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  37.87 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  38.81 
 
 		 300 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  36.4 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  33.64 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  34.98 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  37.02 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  37.61 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  38.33 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  40.74 
 
 		 304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  32.23 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  38.12 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  34.19 
 
 		 249 aa  161  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  38.14 
 
 		 296 aa  161  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 		 334 aa  161  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>