More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06920 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  55.48 
 
 
869 aa  906    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  60.07 
 
 
842 aa  997    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.21 
 
 
847 aa  947    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.22 
 
 
861 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  51.26 
 
 
853 aa  844    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  57.82 
 
 
838 aa  932    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.31 
 
 
832 aa  968    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.72 
 
 
950 aa  980    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  50.95 
 
 
855 aa  825    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.43 
 
 
869 aa  811    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  57 
 
 
877 aa  931    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.34 
 
 
861 aa  908    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  45.31 
 
 
861 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  56.76 
 
 
885 aa  908    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43 
 
 
876 aa  675    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.63 
 
 
837 aa  1001    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.24 
 
 
856 aa  947    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.66 
 
 
837 aa  920    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.22 
 
 
868 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.41 
 
 
861 aa  670    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  51.36 
 
 
842 aa  818    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.43 
 
 
853 aa  949    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  56.79 
 
 
852 aa  907    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.14 
 
 
852 aa  909    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.31 
 
 
835 aa  957    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.17 
 
 
848 aa  968    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  100 
 
 
891 aa  1790    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.98 
 
 
865 aa  907    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.71 
 
 
831 aa  928    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.34 
 
 
847 aa  898    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  56.78 
 
 
830 aa  978    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.46 
 
 
832 aa  914    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.79 
 
 
852 aa  907    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.05 
 
 
894 aa  881    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.28 
 
 
851 aa  897    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.34 
 
 
836 aa  972    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.34 
 
 
870 aa  968    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  48.3 
 
 
860 aa  793    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.23 
 
 
827 aa  994    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.35 
 
 
1231 aa  995    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.2 
 
 
710 aa  800    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  53.62 
 
 
885 aa  837    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.66 
 
 
873 aa  886    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.2 
 
 
866 aa  947    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.64 
 
 
817 aa  250  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.78 
 
 
845 aa  247  9e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  31.73 
 
 
893 aa  204  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  32.74 
 
 
908 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  31.79 
 
 
908 aa  195  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  30.63 
 
 
890 aa  195  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  30.85 
 
 
889 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  33.25 
 
 
905 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  31.36 
 
 
908 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  31.28 
 
 
908 aa  192  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.89 
 
 
952 aa  191  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  30.37 
 
 
924 aa  190  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  30.85 
 
 
927 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.59 
 
 
927 aa  188  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  28.37 
 
 
926 aa  185  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  32.39 
 
 
924 aa  184  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  33.33 
 
 
906 aa  184  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  32.13 
 
 
924 aa  184  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.53 
 
 
815 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.25 
 
 
762 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.25 
 
 
843 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  29.21 
 
 
919 aa  175  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  28.2 
 
 
872 aa  167  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  27.13 
 
 
998 aa  165  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  30.5 
 
 
548 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.05 
 
 
709 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  38.68 
 
 
1026 aa  134  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  32.61 
 
 
693 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  40.43 
 
 
994 aa  132  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  31.35 
 
 
723 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.95 
 
 
950 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  38.16 
 
 
909 aa  130  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.56 
 
 
990 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.79 
 
 
694 aa  129  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.56 
 
 
951 aa  129  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.18 
 
 
919 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.4 
 
 
791 aa  128  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.86 
 
 
984 aa  127  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.86 
 
 
964 aa  127  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.89 
 
 
950 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.82 
 
 
922 aa  127  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  37.75 
 
 
904 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.26 
 
 
799 aa  125  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  39.6 
 
 
935 aa  124  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 
996 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.19 
 
 
933 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  36.32 
 
 
1055 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.2 
 
 
947 aa  122  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  29.72 
 
 
729 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  40.57 
 
 
952 aa  122  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.14 
 
 
951 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.39 
 
 
931 aa  122  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  34.89 
 
 
961 aa  122  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  39.06 
 
 
916 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  28.77 
 
 
824 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  29.19 
 
 
760 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>