39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  100 
 
 		 317 aa  625  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  72.56 
 
 		 314 aa  414  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0829  Bifunctional DNA primase/polymerase  47.39 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  38.3 
 
 		 746 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  38.3 
 
 		 746 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.75 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.64 
 
 		 970 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.64 
 
 		 970 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.14 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  41.67 
 
 		 667 aa  79.7  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  36.15 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  26.78 
 
 		 749 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  36.59 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.59 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  38.85 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  34.62 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.06 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  34.62 
 
 		 717 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.63 
 
 		 599 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.7 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  33.85 
 
 		 717 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  33.85 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  33.85 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  32.76 
 
 		 955 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  25.45 
 
 		 746 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3090  bifunctional DNA primase/polymerase  30.84 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  37.1 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  27.04 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  34.56 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.25 
 
 		 206 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.68 
 
 		 223 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.68 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.68 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1346  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.57 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111909  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.63 
 
 		 1006 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  30.51 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.81 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  27.86 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1506  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.07 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>