More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05420 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 188 aa  356  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  45.4 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  45.6 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 209 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  53.73 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  53.73 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  37.12 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  45.36 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  32.47 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  35.91 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  37.29 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  36.73 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  34.88 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  31.79 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>