225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  100 
 
 		 109 aa  211  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  98.17 
 
 		 109 aa  207  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  60.61 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  42.59 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  54.84 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  50.79 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  45.31 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  46.88 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  61.7 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  45.31 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  62.75 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  43.84 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  42.5 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  43.08 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  43.08 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  43.08 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  47.62 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  40 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  39.73 
 
 		 1196 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  38.03 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  43.55 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  39.68 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  35.21 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  38.98 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  44.26 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  38.33 
 
 		 70 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  47.54 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  39.68 
 
 		 954 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  46.48 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 		 856 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  37.29 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  35.94 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 830 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  45.31 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  35.48 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1427  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0963  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>