More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04920 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  97.75 
 
 		 239 aa  435  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  60.79 
 
 		 297 aa  250  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  64.44 
 
 		 240 aa  248  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  60.71 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  56.96 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.52 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.33 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  61.95 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  57.89 
 
 		 265 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  57.89 
 
 		 265 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  58.08 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  56.09 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  58.77 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  56.09 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  57.89 
 
 		 248 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  58.33 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  56.52 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  56.52 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  56.52 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 		 232 aa  234  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  50.45 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  50.45 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  49.13 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  47.27 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 234 aa  184  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  43.75 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.86 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.51 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.15 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  42.41 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 321 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  42.41 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  42.41 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  42.41 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  42.41 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  42.41 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  42.41 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  42.41 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.87 
 
 		 265 aa  177  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 228 aa  177  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 254 aa  177  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 236 aa  177  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  43.42 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.11 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  49.33 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.34 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  47.32 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>