More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04880 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  73.61 
 
 		 450 aa  646    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  100 
 
 		 435 aa  876    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  73.91 
 
 		 438 aa  658    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  71.17 
 
 		 438 aa  634    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  72.54 
 
 		 438 aa  655    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  74.3 
 
 		 443 aa  655    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  100 
 
 		 435 aa  876    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  75.29 
 
 		 451 aa  667    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  75.29 
 
 		 438 aa  669    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  71.17 
 
 		 438 aa  634    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  72.54 
 
 		 438 aa  655    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  74.3 
 
 		 443 aa  655    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  73.61 
 
 		 450 aa  646    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  73.91 
 
 		 438 aa  658    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  76.98 
 
 		 442 aa  678    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  99.36 
 
 		 311 aa  621  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  69.43 
 
 		 436 aa  619  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  69.59 
 
 		 435 aa  615  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  69.59 
 
 		 435 aa  615  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  69.82 
 
 		 435 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  69.82 
 
 		 435 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  69.82 
 
 		 435 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  69.82 
 
 		 435 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  69.82 
 
 		 435 aa  612  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  72.94 
 
 		 378 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06900  transposase family protein  63.22 
 
 		 436 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0445695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22440  transposase family protein  63.22 
 
 		 436 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0283397  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  74.05 
 
 		 346 aa  525  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2260  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1027  normal  0.0456513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0776  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0439  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.741864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1877  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.493303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4491  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0427  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1867  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1169  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0217925  normal  0.194588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3018  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2168  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00169456  hitchhiker  0.0053123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3079  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1941  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.527296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3429  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  57.14 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  65 
 
 		 362 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.93 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.93 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.93 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.24 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23490  transposase family protein  38.54 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05360  transposase family protein  38.54 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.711648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22400  transposase family protein  38.54 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.323222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1245  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.04 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139986  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3047  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.04 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000291896  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2889  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.04 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124927  hitchhiker  0.00109872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.04 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0990  transposase  47.83 
 
 		 177 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  29.95 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  29.95 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  29.95 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  29.95 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.65 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  30.6 
 
 		 428 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  30.6 
 
 		 428 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  30.6 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0461  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.97 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.97 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.97 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.97 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415277  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2910  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.97 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000150171  hitchhiker  0.0000194691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1765  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.97 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00126506  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.43 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0906  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.43 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4069  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.43 
 
 		 442 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.414136 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1244  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.53 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.661907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0599  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1174  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000815795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1177  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123826  normal  0.601968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0551  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.340213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.520122  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  90.5  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.468712  normal  0.0451791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0373  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.74 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0371  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.66 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  45.28 
 
 		 251 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1035  hypothetical protein  24.94 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2037  hypothetical protein  24.94 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2311  hypothetical protein  24.94 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2402  hypothetical protein  24.94 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  26.01 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  24.62 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.62 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0341  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.717183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2462  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.32 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0936  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.86 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0556  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.33 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2780  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.33 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0010  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.33 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14350  transposase  26.43 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3509  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.48 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1816  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.48 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1949  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.61 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.960551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>