More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04590 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  100 
 
 
551 aa  1023    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.34 
 
 
565 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.38 
 
 
572 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.52 
 
 
544 aa  458  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  56.22 
 
 
592 aa  425  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  53.49 
 
 
576 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  49.36 
 
 
547 aa  389  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.82 
 
 
569 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.86 
 
 
547 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.93 
 
 
601 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
540 aa  329  9e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.67 
 
 
532 aa  326  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
564 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
565 aa  181  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
606 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
663 aa  174  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
634 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
597 aa  169  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
550 aa  143  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.34 
 
 
515 aa  130  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
528 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.69 
 
 
510 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  26.26 
 
 
535 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  26.26 
 
 
535 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  22.14 
 
 
514 aa  99.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  26.05 
 
 
535 aa  98.6  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  37.38 
 
 
261 aa  96.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0236237  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.73 
 
 
547 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.43 
 
 
587 aa  95.9  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  25.98 
 
 
530 aa  95.9  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  34.23 
 
 
277 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.48 
 
 
278 aa  95.1  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  23.2 
 
 
534 aa  94.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  24.71 
 
 
516 aa  94.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  25.8 
 
 
536 aa  94  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.89 
 
 
282 aa  93.6  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  25.65 
 
 
536 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  37.36 
 
 
279 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  24.02 
 
 
516 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  25.59 
 
 
536 aa  93.2  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2779  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  37.78 
 
 
263 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  25.69 
 
 
536 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  25.69 
 
 
536 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.56 
 
 
308 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.33 
 
 
278 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  25.43 
 
 
536 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 
273 aa  92  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.75 
 
 
551 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  25.48 
 
 
536 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  26.48 
 
 
543 aa  91.3  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  25.48 
 
 
536 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  26.19 
 
 
540 aa  91.3  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1393  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.17 
 
 
284 aa  90.9  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  25.32 
 
 
536 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.18 
 
 
279 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0373  sulfate transport protein CysT  35.47 
 
 
272 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03680  sulfate transport protein CysT  35.47 
 
 
272 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000172641 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.33 
 
 
278 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  19.58 
 
 
545 aa  88.6  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  35.05 
 
 
275 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  25.64 
 
 
536 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  35.24 
 
 
275 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  28.8 
 
 
545 aa  87.8  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3835  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.45 
 
 
608 aa  88.2  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  28.26 
 
 
555 aa  88.2  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0292  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.01 
 
 
272 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.48873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  25.64 
 
 
536 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.35 
 
 
545 aa  87.8  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  25.64 
 
 
536 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  25.64 
 
 
536 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.57 
 
 
278 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  25.64 
 
 
536 aa  87.4  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  27.67 
 
 
535 aa  87  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4088  polysaccharide export protein  35.44 
 
 
279 aa  86.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101815 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
569 aa  86.7  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  27.04 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.5 
 
 
543 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  26.82 
 
 
535 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5230  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.01 
 
 
272 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283699  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
274 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.445603  normal  0.607704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5170  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.01 
 
 
272 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451944  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  23.85 
 
 
509 aa  85.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.28 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.58 
 
 
742 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3173  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.31 
 
 
290 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0539  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  38.86 
 
 
293 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.25 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.25 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5077  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.99 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  24.52 
 
 
536 aa  85.5  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.49 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.84 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  36.23 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  24.11 
 
 
564 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  30.66 
 
 
531 aa  84.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1045  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.45 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0309  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  35.8 
 
 
273 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
293 aa  84  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>