36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04150 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  100 
 
 
392 aa  787    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  33.54 
 
 
368 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  31.21 
 
 
503 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  33.14 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  35.44 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  30.31 
 
 
499 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  28.22 
 
 
500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  30.75 
 
 
500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  30.75 
 
 
522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.98 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.52 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  33.43 
 
 
496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  29.46 
 
 
507 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.98 
 
 
384 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  36.7 
 
 
346 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  38.1 
 
 
522 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  31.73 
 
 
349 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  30.55 
 
 
488 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  32.76 
 
 
501 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.66 
 
 
387 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  34.65 
 
 
344 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.91 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  28.78 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  29.61 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.16 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.85 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.26 
 
 
457 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.87 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 
494 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.67 
 
 
800 aa  63.5  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1075  hypothetical protein  34.82 
 
 
419 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000439161  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  29.05 
 
 
823 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3524  hypothetical protein  25.96 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  28.45 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.44 
 
 
222 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.95 
 
 
696 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>