151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03900 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.56 
 
 
219 aa  214  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  53.52 
 
 
214 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  56.22 
 
 
219 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.24 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  57.22 
 
 
215 aa  191  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  51.36 
 
 
221 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.73 
 
 
216 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  47.37 
 
 
227 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.22 
 
 
218 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.84 
 
 
223 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.81 
 
 
213 aa  132  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.4 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.09 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.09 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.09 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 
227 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.28 
 
 
220 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  42.86 
 
 
220 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.55 
 
 
216 aa  121  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  44.86 
 
 
216 aa  121  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  40.19 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  40.83 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  35.81 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.64 
 
 
230 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.97 
 
 
218 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  42.07 
 
 
214 aa  108  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
218 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  35.35 
 
 
218 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.37 
 
 
221 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  35.6 
 
 
218 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.79 
 
 
211 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
213 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.48 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  33.51 
 
 
221 aa  94.7  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  33.51 
 
 
221 aa  94.7  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
215 aa  92  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
212 aa  89  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 
230 aa  88.2  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
209 aa  85.1  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.77 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  28.31 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  39.63 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  31.02 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  36.02 
 
 
374 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  31.36 
 
 
280 aa  75.1  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.85 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.33 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  29.17 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  27.81 
 
 
255 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.31 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  27.31 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  27.31 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
306 aa  59.3  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
291 aa  55.1  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  26.11 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  25 
 
 
282 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
298 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  27.04 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
309 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
308 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  24.47 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.14 
 
 
320 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
318 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  29.27 
 
 
223 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  26.75 
 
 
291 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  23.56 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.49 
 
 
327 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.5 
 
 
320 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1459  hypothetical protein  29.27 
 
 
329 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.487858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.85 
 
 
328 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  26.62 
 
 
339 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  29.94 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.5 
 
 
320 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
301 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.85 
 
 
320 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
320 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  27.65 
 
 
203 aa  48.5  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  22.5 
 
 
282 aa  48.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  26.03 
 
 
221 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  27.88 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  28.65 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  27.04 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0225726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>