171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03590 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 
386 aa  751    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.56 
 
 
360 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.62 
 
 
361 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  54.31 
 
 
361 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  53.28 
 
 
369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  54.12 
 
 
379 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  54.8 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  48.89 
 
 
389 aa  312  5.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  51.79 
 
 
396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  48.55 
 
 
335 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  49.56 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  48.83 
 
 
328 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  48.67 
 
 
398 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  48.43 
 
 
352 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  49.28 
 
 
340 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  46.42 
 
 
343 aa  252  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50 
 
 
352 aa  243  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.66 
 
 
324 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.43 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  44.51 
 
 
369 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.9 
 
 
369 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.82 
 
 
369 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  44.16 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  47.17 
 
 
369 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  39.94 
 
 
364 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  37.87 
 
 
376 aa  206  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  41.06 
 
 
344 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  40.83 
 
 
389 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  38.63 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41 
 
 
361 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.76 
 
 
356 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  37.76 
 
 
356 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.97 
 
 
367 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  37.46 
 
 
356 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  38.9 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.68 
 
 
409 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  29.63 
 
 
384 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  29.5 
 
 
375 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  29.97 
 
 
342 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  29.04 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4360  folate-binding protein YgfZ  34.34 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689561  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  28.62 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  29.02 
 
 
336 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  31.58 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.27 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  30.75 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  30.25 
 
 
322 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.74 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1013  folate-binding protein YgfZ  29.33 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  31.65 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  30.17 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.52 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  28.71 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.5 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.37 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0309  aminomethyl transferase family protein  23.58 
 
 
268 aa  72  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  30.13 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  30.77 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.47 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.25 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.93 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.3 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  30 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2267  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  26.83 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.9 
 
 
354 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.31 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  26.61 
 
 
325 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1357  glycine cleavage T protein  25.58 
 
 
313 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  30.59 
 
 
284 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1165  folate-binding protein YgfZ  27.76 
 
 
284 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818193  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  30.59 
 
 
284 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  29.41 
 
 
326 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.08 
 
 
328 aa  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.45 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  27.89 
 
 
348 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.45 
 
 
324 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  25.4 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  25.7 
 
 
339 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1432  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.49 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2521  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.31 
 
 
317 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0149913  hitchhiker  0.00318223 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.69 
 
 
282 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.503998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.69 
 
 
327 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  26.44 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2940  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.52 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.352014  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  26.2 
 
 
280 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1462  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  25.69 
 
 
279 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  25.56 
 
 
344 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  29.06 
 
 
354 aa  57.4  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3962  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.08 
 
 
315 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.812707  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2505  folate-binding protein YgfZ  26.32 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.61 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.34 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0262  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  29.15 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00715457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4761  hypothetical protein  28.12 
 
 
314 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1946  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.38 
 
 
317 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0812  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.94 
 
 
273 aa  53.9  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54480  hypothetical protein  26.8 
 
 
314 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.812982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.44 
 
 
348 aa  53.1  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1754  folate-binding protein YgfZ  28.32 
 
 
277 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.3 
 
 
336 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.0659803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>