78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02100 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  49.67 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 214 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  42.02 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  39.46 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  38.6 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  37.71 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  38.73 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  38.33 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  35.23 
 
 		 232 aa  94.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  35.4 
 
 		 192 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  33.53 
 
 		 224 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  37.97 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  35.22 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.24 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  37.01 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  35.96 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  35.37 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  34.06 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  33.99 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  46.05 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  34.23 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  30.87 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  33.55 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  38.85 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  31.93 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  35.81 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  58.82 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 101 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 88 aa  46.2  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 107 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 102 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 117 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 102 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 112 aa  45.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  41.79 
 
 		 249 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 112 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 102 aa  44.7  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  32.98 
 
 		 97 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2815  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.897524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  25.49 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 94 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  31.48 
 
 		 119 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  44.23 
 
 		 114 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 472 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 306 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 97 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  45.28 
 
 		 113 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  31.58 
 
 		 107 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  31.58 
 
 		 107 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 121 aa  42  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  44.29 
 
 		 176 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 120 aa  42  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  39.39 
 
 		 120 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 142 aa  42  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 125 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  39.68 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  30.86 
 
 		 110 aa  41.2  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>