More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 204 aa  394  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  63.37 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  63.68 
 
 		 203 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  62.93 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  64 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  63.5 
 
 		 202 aa  237  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  61.58 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 199 aa  235  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  61.84 
 
 		 210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  61.46 
 
 		 220 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  62.87 
 
 		 202 aa  234  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  62.38 
 
 		 221 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  61.76 
 
 		 209 aa  229  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  59.62 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  59.62 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  59.13 
 
 		 203 aa  228  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  60.78 
 
 		 200 aa  222  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  60.1 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  59.11 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  59.02 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  58.96 
 
 		 208 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  59.22 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  58.33 
 
 		 196 aa  207  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  60.8 
 
 		 212 aa  207  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  56.62 
 
 		 227 aa  206  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  55.28 
 
 		 208 aa  200  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  54.15 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  54.77 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  53 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  53.66 
 
 		 227 aa  191  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  54.46 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  48.26 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 226 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  55 
 
 		 214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  47.8 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  48.76 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  46.04 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  49.25 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  50.49 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  47.57 
 
 		 216 aa  174  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  48.54 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  47.8 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 215 aa  171  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  49.27 
 
 		 220 aa  171  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  44.39 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.29 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  45.5 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  45.81 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  49.01 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  48.29 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  48.29 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  48.29 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  42.65 
 
 		 239 aa  167  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  48.29 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  53.47 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  46 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  45.73 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  48.78 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  47.12 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.32 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  42 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  47.87 
 
 		 205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  43.14 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 		 205 aa  164  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>