More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01500 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  63.41 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  64.35 
 
 		 126 aa  160  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  61.02 
 
 		 120 aa  158  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  58.33 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  57.72 
 
 		 123 aa  154  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  56.67 
 
 		 123 aa  153  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  50.41 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  58.26 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  57.98 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  59.13 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  55.3 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  62.71 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  57.39 
 
 		 120 aa  150  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  56.67 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  59.48 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  55.15 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  56.56 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  58.04 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  54.1 
 
 		 123 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  56.03 
 
 		 117 aa  146  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  56.52 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  56.56 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  49.18 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  51.67 
 
 		 125 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  52.89 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  52.03 
 
 		 124 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  50.41 
 
 		 125 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  50 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  50 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  49.59 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  50 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  52.94 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  52.42 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  52.03 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  52.03 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  52.85 
 
 		 124 aa  140  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  52.14 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  55.26 
 
 		 149 aa  137  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  55.45 
 
 		 120 aa  136  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  44.8 
 
 		 132 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  44.8 
 
 		 132 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  53.33 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  48.7 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  51.69 
 
 		 123 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  52.5 
 
 		 123 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  49.11 
 
 		 123 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  48 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  44.53 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  50.89 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  44.07 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  50.89 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  48.33 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  49.54 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  53.21 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  51.67 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  51.67 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  51.67 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  53.21 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  42.11 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  43.75 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  34.68 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  34.68 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  50.98 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  45.87 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  38.79 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  38.79 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  44.55 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  43.69 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  42.31 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  42.86 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  42.72 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  42.72 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  41.75 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  41.75 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  46.46 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  41.75 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  43 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  46.08 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  42.72 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  39.05 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  40.78 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  43.75 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  40 
 
 		 113 aa  85.5  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  36.61 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  39 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  39 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  39 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  39.74 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>