286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00940  cytosine/adenosine deaminase  100 
 
 
175 aa  356  1e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  46.26 
 
 
157 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.23 
 
 
157 aa  91.3  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  39.23 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.66 
 
 
161 aa  81.6  5e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.52 
 
 
164 aa  80.9  9e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35 
 
 
164 aa  77.4  9e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.55 
 
 
161 aa  76.6  2e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.34 
 
 
155 aa  76.3  2e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.56 
 
 
223 aa  74.3  8e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
160 aa  72.8  2e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.09 
 
 
157 aa  72.4  3e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.34 
 
 
157 aa  72.4  3e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.31 
 
 
163 aa  72.4  3e-12  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  37.16 
 
 
186 aa  72  4e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  45.57 
 
 
167 aa  71.2  7e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.33 
 
 
183 aa  71.2  7e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  39.58 
 
 
158 aa  70.1  1e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  38.18 
 
 
163 aa  70.5  1e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.47 
 
 
150 aa  69.7  2e-11  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  33.63 
 
 
147 aa  68.9  4e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  30.08 
 
 
156 aa  68.6  4e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.34 
 
 
152 aa  68.2  6e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  34.62 
 
 
151 aa  67.8  8e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
158 aa  67  1e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.81 
 
 
161 aa  67.4  1e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.48458e-10 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.27 
 
 
155 aa  66.6  2e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  1.94857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.48 
 
 
155 aa  66.6  2e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  34.62 
 
 
151 aa  65.1  5e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35 
 
 
211 aa  65.1  5e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  39.51 
 
 
155 aa  64.7  6e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  30.56 
 
 
153 aa  64.3  7e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.4 
 
 
168 aa  64.7  7e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  38.6 
 
 
158 aa  62.8  2e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  28.87 
 
 
157 aa  63.2  2e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.96 
 
 
157 aa  62.4  3e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.34 
 
 
153 aa  62.4  3e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.78 
 
 
159 aa  62  4e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.59 
 
 
158 aa  62  4e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  34.78 
 
 
159 aa  62  4e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.5 
 
 
163 aa  62  4e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  30.26 
 
 
190 aa  62.4  4e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  39.51 
 
 
153 aa  61.6  5e-09  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.83 
 
 
158 aa  61.6  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.24 
 
 
156 aa  61.2  7e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.86 
 
 
160 aa  61.2  7e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.84 
 
 
160 aa  60.8  9e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.4 
 
 
163 aa  60.5  1e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.63 
 
 
190 aa  60.1  2e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.24 
 
 
155 aa  58.9  3e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  42.86 
 
 
151 aa  59.3  3e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  29.38 
 
 
188 aa  58.5  4e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.58 
 
 
155 aa  58.9  4e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.72 
 
 
159 aa  58.9  4e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  39.39 
 
 
164 aa  58.5  5e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  32.8 
 
 
176 aa  58.2  6e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.05 
 
 
154 aa  58.2  6e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1476  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.76 
 
 
151 aa  57.8  7e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.65 
 
 
214 aa  57.8  7e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  40.74 
 
 
150 aa  57.8  8e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  5.96631e-06  hitchhiker  1.10312e-06 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  32.73 
 
 
154 aa  57.8  8e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.87 
 
 
152 aa  57  1e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
176 aa  56.2  2e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  31.11 
 
 
149 aa  56.2  2e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  41.43 
 
 
161 aa  56.2  2e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.25 
 
 
190 aa  56.2  2e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.17 
 
 
149 aa  55.8  3e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  27.54 
 
 
154 aa  55.1  5e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  27.54 
 
 
154 aa  55.1  5e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.78 
 
 
169 aa  55.1  5e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.67 
 
 
521 aa  54.7  6e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.27 
 
 
188 aa  54.7  7e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  44.59 
 
 
170 aa  54.7  7e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.17 
 
 
154 aa  54.3  8e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.56 
 
 
161 aa  54.3  9e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.67 
 
 
145 aa  53.9  1e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.79 
 
 
171 aa  53.9  1e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.46 
 
 
159 aa  53.9  1e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.76 
 
 
148 aa  53.1  2e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  39.13 
 
 
176 aa  52.8  2e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0007  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  23.53 
 
 
147 aa  53.5  2e-06  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1808  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.86 
 
 
191 aa  52.8  2e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.0647304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
165 aa  52.8  2e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.44 
 
 
142 aa  52.8  2e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  48.53 
 
 
137 aa  53.1  2e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.21 
 
 
167 aa  52.4  3e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0427  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.16 
 
 
171 aa  52.4  3e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.59 
 
 
168 aa  52.4  3e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1916  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.58 
 
 
140 aa  52.4  3e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.3 
 
 
159 aa  52.8  3e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.79 
 
 
164 aa  52  4e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.77 
 
 
475 aa  52  4e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.04 
 
 
176 aa  52  4e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  46.77 
 
 
182 aa  52  4e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  40.96 
 
 
144 aa  52  4e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.23 
 
 
185 aa  52.4  4e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.7 
 
 
484 aa  52.4  4e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  44.44 
 
 
168 aa  52  5e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.62 
 
 
153 aa  51.6  5e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.22 
 
 
190 aa  51.6  5e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>