More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00930  cation/cationic drug transporter  100 
 
 
122 aa  227  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4238  small multidrug resistance protein  72.28 
 
 
106 aa  140  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.644322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4110  SugE protein  71.29 
 
 
106 aa  125  2e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4261  small multidrug resistance protein  72.28 
 
 
106 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 
114 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8162  transporter  46.53 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 
109 aa  77.4  7e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7227  small multidrug resistance protein  42.53 
 
 
104 aa  76.6  1e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 
106 aa  72  3e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 
106 aa  70.5  7e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 
105 aa  68.9  2e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  40 
 
 
110 aa  68.6  3e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 
105 aa  66.2  1e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
101 aa  66.2  2e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  33.66 
 
 
104 aa  66.2  2e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 
106 aa  61.2  4e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  39.22 
 
 
109 aa  60.8  6e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 
109 aa  60.8  6e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 
116 aa  60.8  6e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 
109 aa  60.8  6e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  8.3233e-05 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 
104 aa  60.5  7e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 
104 aa  60.5  7e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 
110 aa  60.1  9e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40.95 
 
 
110 aa  59.3  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 
104 aa  58.5  3e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  31.63 
 
 
106 aa  58.5  3e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 
104 aa  58.5  3e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  32.69 
 
 
114 aa  58.2  4e-08  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  42.71 
 
 
113 aa  58.2  4e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 
126 aa  58.2  4e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  28.71 
 
 
105 aa  57.8  4e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  34.86 
 
 
110 aa  57.8  5e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  34.86 
 
 
110 aa  57.8  5e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 
109 aa  57.4  6e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 
107 aa  57.8  6e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
109 aa  57.4  7e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 
111 aa  57.4  7e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 
109 aa  57.4  7e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 
130 aa  57  9e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  34.65 
 
 
146 aa  57  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  34.65 
 
 
146 aa  57  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  27.72 
 
 
106 aa  57  9e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  36.04 
 
 
112 aa  56.2  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
104 aa  56.6  1e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  36.04 
 
 
112 aa  56.2  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  36.94 
 
 
112 aa  56.6  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  36.04 
 
 
112 aa  56.2  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
105 aa  56.2  1e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 
106 aa  55.8  2e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4733  transporter  36.63 
 
 
101 aa  55.8  2e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
109 aa  55.8  2e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 
108 aa  55.8  2e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  39.08 
 
 
106 aa  55.5  2e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
105 aa  55.8  2e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
109 aa  55.1  3e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  37.72 
 
 
109 aa  55.1  3e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2011  SugE protein  32.04 
 
 
105 aa  55.5  3e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  36.04 
 
 
112 aa  55.5  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 
153 aa  54.7  4e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  34.95 
 
 
104 aa  54.7  4e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  33.66 
 
 
120 aa  54.3  5e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54110  transporter  35.64 
 
 
101 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  39.42 
 
 
108 aa  54.7  5e-07  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  33.66 
 
 
120 aa  54.3  5e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  37.27 
 
 
114 aa  54.3  6e-07  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  31.68 
 
 
107 aa  54.3  6e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  31.68 
 
 
104 aa  53.9  7e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  31.68 
 
 
105 aa  53.9  7e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  34.34 
 
 
110 aa  53.9  7e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  39.22 
 
 
108 aa  53.9  7e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  38.37 
 
 
110 aa  53.9  7e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  33.66 
 
 
120 aa  53.9  8e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4237  small multidrug resistance protein  34.02 
 
 
129 aa  53.5  9e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.492024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4260  small multidrug resistance protein  34.02 
 
 
129 aa  53.5  9e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  37.25 
 
 
107 aa  53.5  1e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  32.67 
 
 
120 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.65 
 
 
110 aa  53.1  1e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  32.67 
 
 
105 aa  53.1  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  2.05037e-06 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.65 
 
 
110 aa  53.1  1e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3295  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 
108 aa  53.1  1e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  37.5 
 
 
112 aa  53.1  1e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  32.69 
 
 
108 aa  53.1  1e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4109  cation membrane transporter  34.02 
 
 
127 aa  52.8  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  32.67 
 
 
120 aa  52.8  2e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  30.1 
 
 
105 aa  52.4  2e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 
111 aa  52.4  2e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 
110 aa  52.4  2e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 
109 aa  52.8  2e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 
136 aa  52.8  2e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  32.67 
 
 
120 aa  52.8  2e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 
104 aa  52  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
123 aa  52.4  2e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 
103 aa  51.6  3e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  31.68 
 
 
104 aa  52  3e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  32 
 
 
109 aa  52  3e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 
105 aa  52  3e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  27.72 
 
 
106 aa  52  3e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3601  SugE protein  30.69 
 
 
105 aa  52  3e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51586  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  28.97 
 
 
108 aa  52  3e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  27.72 
 
 
106 aa  52  3e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>