46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00920 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07920    100 
 
 
1267 bp  2500  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05340    100 
 
 
1267 bp  2500  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00920    100 
 
 
1261 bp  2500  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05280    99.68 
 
 
1297 bp  2468  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  82.95 
 
 
1137 bp  654  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  99.37 
 
 
1329 bp  2428  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0230    82.78 
 
 
1328 bp  617  1e-174  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0928078  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  79.8 
 
 
1332 bp  398  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  79.8 
 
 
1332 bp  398  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  80.02 
 
 
1041 bp  387  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  80.6 
 
 
1308 bp  363  8e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  80.6 
 
 
1308 bp  363  8e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  81.95 
 
 
1317 bp  325  2e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  81.95 
 
 
1317 bp  325  2e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  91.44 
 
 
1353 bp  244  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  91.44 
 
 
1353 bp  244  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  82.04 
 
 
936 bp  222  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  87.88 
 
 
1317 bp  202  2e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  87.88 
 
 
1317 bp  202  2e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  81.53 
 
 
1308 bp  200  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.30543e-18  hitchhiker  7.42439e-05 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  81.53 
 
 
1308 bp  200  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  81.53 
 
 
1308 bp  200  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17100    81.53 
 
 
2292 bp  200  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0207297  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  81.53 
 
 
1308 bp  200  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  81.53 
 
 
1308 bp  200  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  82.53 
 
 
1308 bp  198  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  82.53 
 
 
1308 bp  198  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  79.92 
 
 
1317 bp  196  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  79.92 
 
 
1356 bp  196  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    79.92 
 
 
2767 bp  196  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  80.81 
 
 
1317 bp  174  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  78.64 
 
 
1317 bp  174  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  88.89 
 
 
1311 bp  149  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2570    78.45 
 
 
538 bp  109  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  83.13 
 
 
1089 bp  107  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22440  transposase family protein  81.05 
 
 
1311 bp  103  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0283397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06900  transposase family protein  81.05 
 
 
1311 bp  103  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0445695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02650    85.15 
 
 
123 bp  81.8  4e-13  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0990  transposase  88.06 
 
 
534 bp  69.9  2e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  85.06 
 
 
1311 bp  69.9  2e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  85.06 
 
 
1311 bp  69.9  2e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  85.06 
 
 
1311 bp  69.9  2e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4443    87.69 
 
 
560 bp  65.9  3e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12824  transposase  92.31 
 
 
399 bp  54  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000191598  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25590    85.71 
 
 
399 bp  48.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3565  NmrA family protein  91.67 
 
 
1497 bp  48.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.803676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>