More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00910 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00910  cation/cationic drug transporter  100 
 
 
132 aa  251  2e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4237  small multidrug resistance protein  62.22 
 
 
129 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.492024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4260  small multidrug resistance protein  63.71 
 
 
129 aa  145  2e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4109  cation membrane transporter  62.02 
 
 
127 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  45.13 
 
 
114 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 
104 aa  79.7  1e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  40.78 
 
 
104 aa  79  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  47.52 
 
 
107 aa  79.3  2e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 
122 aa  77.4  6e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 
105 aa  77  8e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8162  transporter  47.17 
 
 
106 aa  76.6  9e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  43.27 
 
 
107 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 
130 aa  75.9  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 
110 aa  75.1  3e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 
109 aa  75.5  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.12 
 
 
107 aa  75.1  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  40.71 
 
 
153 aa  74.7  4e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  38.83 
 
 
104 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  36.19 
 
 
114 aa  74.3  5e-13  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
105 aa  74.3  5e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 
106 aa  73.9  7e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 
104 aa  73.6  8e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
105 aa  73.6  8e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4238  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 
106 aa  73.6  9e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.644322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 
105 aa  72.8  1e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 
104 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  40.2 
 
 
104 aa  73.2  1e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 
105 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  40.17 
 
 
134 aa  72.8  1e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7227  small multidrug resistance protein  49.4 
 
 
104 aa  72.4  2e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 
104 aa  72  2e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.72 
 
 
104 aa  72.4  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 
105 aa  72.8  2e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
106 aa  72.4  2e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  40.95 
 
 
107 aa  72.4  2e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 
107 aa  72.4  2e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 
108 aa  71.6  3e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 
105 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 
105 aa  71.6  3e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  39 
 
 
111 aa  71.2  4e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  40.59 
 
 
104 aa  71.2  5e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  40 
 
 
106 aa  70.9  5e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 
104 aa  71.2  5e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 
104 aa  70.9  5e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 
104 aa  70.9  6e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  40 
 
 
105 aa  70.9  6e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 
101 aa  70.1  9e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 
105 aa  70.1  9e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 
104 aa  70.1  1e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 
104 aa  70.1  1e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 
107 aa  68.9  2e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 
107 aa  68.6  2e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 
105 aa  69.3  2e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  38.61 
 
 
104 aa  68.9  2e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  38 
 
 
106 aa  69.3  2e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
106 aa  68.2  3e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
106 aa  68.2  3e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  39.22 
 
 
146 aa  68.6  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  39.22 
 
 
146 aa  68.6  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 
106 aa  68.2  3e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 
116 aa  68.6  3e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  40 
 
 
105 aa  68.6  3e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 
104 aa  68.2  3e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 
106 aa  68.2  3e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
106 aa  68.2  3e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 
104 aa  68.2  4e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
106 aa  68.2  4e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 
155 aa  67.8  5e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  38 
 
 
106 aa  67.4  6e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 
112 aa  67.4  6e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.42 
 
 
105 aa  67.4  6e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  2.05037e-06 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  36 
 
 
106 aa  67  8e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3796  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 
107 aa  66.6  1e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 
106 aa  66.6  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 
106 aa  66.2  1e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 
104 aa  66.6  1e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  36 
 
 
106 aa  66.6  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  42 
 
 
104 aa  66.2  1e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 
104 aa  66.2  1e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 
106 aa  66.2  1e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 
105 aa  65.9  2e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 
105 aa  65.5  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 
105 aa  65.5  2e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 
105 aa  65.5  2e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 
105 aa  65.5  2e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 
105 aa  65.9  2e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 
105 aa  65.5  2e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  65.9  2e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  38.46 
 
 
105 aa  65.9  2e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
104 aa  65.1  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 
105 aa  65.1  3e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 
105 aa  65.1  3e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 
106 aa  65.1  3e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
104 aa  64.7  4e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  41.35 
 
 
106 aa  64.7  4e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  40 
 
 
104 aa  64.7  4e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 
108 aa  64.7  4e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 
107 aa  64.3  5e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  39.81 
 
 
106 aa  64.3  5e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>