More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  100 
 
 
129 aa  254  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  46.85 
 
 
114 aa  103  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  46.02 
 
 
130 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  44.04 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  46.3 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  43.22 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 
126 aa  79.7  1e-14  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  42.73 
 
 
145 aa  79  2e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  51.43 
 
 
125 aa  75.1  3e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 
147 aa  72  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 
133 aa  71.6  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 
123 aa  72  3e-12  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 
138 aa  71.2  4e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  39.6 
 
 
119 aa  69.7  1e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
120 aa  68.9  2e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
113 aa  68.2  3e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 
135 aa  68.6  3e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
128 aa  66.2  1e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
128 aa  66.2  1e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
113 aa  66.6  1e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
136 aa  65.5  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
128 aa  66.2  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
128 aa  65.5  2e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
113 aa  65.9  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  65.9  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
122 aa  65.1  3e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
128 aa  64.7  4e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 
122 aa  64.7  4e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 
123 aa  64.7  4e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 
140 aa  64.3  5e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
122 aa  63.9  6e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
122 aa  64.3  6e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 
122 aa  63.9  7e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
122 aa  63.9  7e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 
122 aa  63.9  7e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
121 aa  63.5  8e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
121 aa  63.5  8e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
137 aa  63.5  9e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  35.45 
 
 
119 aa  63.5  9e-10  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
152 aa  63.2  1e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
138 aa  62.8  2e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 
122 aa  62.4  2e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
138 aa  62  2e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 
123 aa  62  3e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
152 aa  61.6  3e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  36.94 
 
 
129 aa  61.6  4e-09  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 
131 aa  60.5  7e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 
122 aa  60.1  9e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  41.79 
 
 
129 aa  59.7  1e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
128 aa  59.7  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 
152 aa  59.7  1e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 
146 aa  59.7  1e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 
160 aa  59.7  1e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  33.7 
 
 
137 aa  59.7  1e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
158 aa  59.3  2e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 
152 aa  59.3  2e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  40.3 
 
 
129 aa  58.9  2e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
117 aa  58.5  3e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
163 aa  58.5  3e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
128 aa  58.5  3e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 
124 aa  58.2  4e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 
135 aa  57.8  4e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
156 aa  58.2  4e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0427  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
144 aa  58.2  4e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 
152 aa  57.4  7e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  31.78 
 
 
112 aa  57  8e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
147 aa  57  8e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  39.33 
 
 
145 aa  57  8e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 
117 aa  56.6  1e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
118 aa  56.2  1e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
390 aa  55.5  2e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 
141 aa  55.5  2e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 
157 aa  55.8  2e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
155 aa  55.5  2e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.18 
 
 
132 aa  55.5  2e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
163 aa  55.8  2e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
254 aa  55.5  2e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
171 aa  55.5  2e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
249 aa  55.8  2e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
159 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
159 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  29.75 
 
 
449 aa  55.5  2e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
151 aa  55.5  2e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
153 aa  55.5  2e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
118 aa  56.2  2e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
119 aa  55.8  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 
142 aa  55.5  2e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
159 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 
143 aa  55.8  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 
155 aa  56.2  2e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 
137 aa  55.1  3e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
134 aa  55.1  3e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
153 aa  55.1  3e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
127 aa  55.1  3e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 
142 aa  55.5  3e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
144 aa  55.5  3e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.36 
 
 
161 aa  55.1  3e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
150 aa  55.1  3e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>