More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00880 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  100 
 
 
458 aa  882  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 
474 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.49 
 
 
527 aa  197  2e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  37.34 
 
 
471 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.99 
 
 
788 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  34.51 
 
 
489 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  34.71 
 
 
498 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 
485 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 
763 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  36.67 
 
 
500 aa  184  2e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  34.16 
 
 
486 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 
487 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  31.42 
 
 
470 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  31.44 
 
 
497 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
508 aa  175  1e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 
487 aa  175  2e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.59 
 
 
498 aa  175  2e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 
553 aa  173  7e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
513 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
486 aa  171  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 
478 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  6.83759e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
478 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.27 
 
 
463 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  2.85964e-05 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
463 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.63 
 
 
463 aa  167  3e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
494 aa  167  3e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.47 
 
 
487 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 
1112 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 
514 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  32.92 
 
 
454 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
472 aa  163  5e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.55 
 
 
519 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 
500 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.72 
 
 
543 aa  163  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
503 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
457 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 
522 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
482 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 
458 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  33.57 
 
 
468 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  33.57 
 
 
468 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
486 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
486 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
486 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
486 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
486 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
486 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  32.04 
 
 
490 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  29.02 
 
 
440 aa  159  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  34.67 
 
 
481 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
494 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 
509 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 
491 aa  158  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 
478 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 
493 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  31.65 
 
 
481 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 
469 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 
534 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  32.4 
 
 
543 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  33.9 
 
 
470 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
501 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  30.84 
 
 
469 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.29 
 
 
452 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  35.18 
 
 
397 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 
478 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 
500 aa  152  9e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  31.49 
 
 
480 aa  152  9e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.45 
 
 
466 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 
483 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  30.36 
 
 
489 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.26 
 
 
478 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1772  major facilitator transporter  35.22 
 
 
487 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.819492  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  29.68 
 
 
472 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
508 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
466 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  7.96608e-10 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.48 
 
 
469 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 
490 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  32.69 
 
 
555 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 
502 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
524 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  33.26 
 
 
460 aa  149  1e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 
477 aa  149  1e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 
469 aa  148  2e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  33 
 
 
470 aa  148  2e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  7.00007e-06 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  29.19 
 
 
492 aa  148  2e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  32.03 
 
 
483 aa  148  2e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
487 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  32.97 
 
 
468 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 
478 aa  147  4e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 
484 aa  147  4e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 
482 aa  146  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.93 
 
 
500 aa  146  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 
508 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.23 
 
 
489 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3744  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
484 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.88 
 
 
522 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.76 
 
 
488 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08237e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 
478 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
467 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0624  major facilitator transporter  30.71 
 
 
475 aa  143  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>