16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00840 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00840  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  852  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  28.64 
 
 
1213 aa  68.2  3e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0114  hypothetical protein  26.21 
 
 
306 aa  65.9  1e-09  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3065  hypothetical protein  29.95 
 
 
563 aa  61.6  3e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00980  hypothetical protein  55.26 
 
 
38 aa  53.9  5e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1344  hypothetical protein  28.91 
 
 
284 aa  52  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4523  hypothetical protein  28.81 
 
 
260 aa  50.4  5e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1199  glycosyltransferase  28.22 
 
 
289 aa  50.1  7e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5388  hypothetical protein  23.5 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2519  putative glycosyltransferase  27.8 
 
 
292 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1356  glycosyltransferase  23.64 
 
 
301 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1198  hypothetical protein  25.34 
 
 
295 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0241  hypothetical protein  27.5 
 
 
299 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4747  hypothetical protein  25.87 
 
 
343 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2891  hypothetical protein  24.21 
 
 
282 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1358  glycosyltransferase  22.67 
 
 
296 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>