72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00820 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00820  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
268 aa  513  1e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2881  3-dehydroquinate dehydratase  32.31 
 
 
257 aa  120  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  34.29 
 
 
253 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12510  3-dehydroquinate dehydratase, type I  33.06 
 
 
259 aa  112  8e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1160  3-dehydroquinate dehydratase  29.5 
 
 
293 aa  112  8e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06550  3-dehydroquinate dehydratase, type I  35.66 
 
 
255 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1386  3-dehydroquinate dehydratase  29.88 
 
 
252 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1814  3-dehydroquinate dehydratase  31.15 
 
 
252 aa  108  8e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1470  3-dehydroquinate dehydratase  31.78 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21823  normal  0.0154029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3464  3-dehydroquinate dehydratase, type I  36.19 
 
 
262 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2381  3-dehydroquinate dehydratase  33.88 
 
 
264 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1489  3-dehydroquinate dehydratase  30.74 
 
 
252 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0179338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1454  3-dehydroquinate dehydratase  30.74 
 
 
252 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.287229  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1985  3-dehydroquinate dehydratase  30.74 
 
 
252 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2125  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.86 
 
 
270 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2023  3-dehydroquinate dehydratase  29.39 
 
 
259 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1774  3-dehydroquinate dehydratase  30.71 
 
 
252 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1896  3-dehydroquinate dehydratase  30.45 
 
 
252 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01662  3-dehydroquinate dehydratase  30.71 
 
 
252 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01651  hypothetical protein  30.71 
 
 
252 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1938  3-dehydroquinate dehydratase  30.71 
 
 
252 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2355  3-dehydroquinate dehydratase, type I  22.05 
 
 
246 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.17389e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2409  3-dehydroquinate dehydratase  30.29 
 
 
252 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1503  3-dehydroquinate dehydratase  30.29 
 
 
252 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0828  3-dehydroquinate dehydratase  25.78 
 
 
238 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0845  3-dehydroquinate dehydratase  25.78 
 
 
238 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.403123  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1949  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.29 
 
 
252 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1391  3-dehydroquinate dehydratase, type I  34.52 
 
 
277 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1909  3-dehydroquinate dehydratase  29.88 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1805  3-dehydroquinate dehydratase  31.09 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  1.49393e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.39 
 
 
226 aa  88.6  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15040  3-dehydroquinate dehydratase, type I  32.42 
 
 
264 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0198448  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0705  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.84 
 
 
218 aa  85.9  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.555619  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0481  3-dehydroquinate dehydratase  23.85 
 
 
238 aa  84.3  2e-15  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0688  3-dehydroquinate dehydratase  28.19 
 
 
225 aa  84.3  2e-15  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  30.09 
 
 
233 aa  83.6  3e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0639  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.72 
 
 
218 aa  81.3  2e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0375735  normal  0.0370197 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2171  3-dehydroquinate dehydratase  28.38 
 
 
233 aa  80.5  3e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.70771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0010  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.38 
 
 
233 aa  80.5  3e-14  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.406565  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0184  3-dehydroquinate dehydratase  26.73 
 
 
218 aa  80.5  3e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.836768  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  21.94 
 
 
228 aa  79.3  5e-14  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.88162e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1279  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.24 
 
 
218 aa  78.6  9e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.02452  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0132  3-dehydroquinate dehydratase, type I  23.53 
 
 
218 aa  77.4  3e-13  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0627989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_409  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.29 
 
 
222 aa  76.3  6e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1815  3-dehydroquinate dehydratase  25.31 
 
 
263 aa  75.5  9e-13  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.628603  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1379  3-dehydroquinate dehydratase  25.94 
 
 
225 aa  75.5  9e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0591105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0922  3-dehydroquinate dehydratase  28.64 
 
 
242 aa  74.3  2e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1570  dehydroquinase class I  32.11 
 
 
209 aa  73.2  4e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251567  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0817  3-dehydroquinate dehydratase  28.64 
 
 
247 aa  72.4  8e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  33.99 
 
 
526 aa  72  8e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_002936  DET0466  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.83 
 
 
222 aa  70.5  2e-11  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3033  3-dehydroquinate dehydratase  34.39 
 
 
226 aa  70.5  3e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4110  3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase  29.83 
 
 
613 aa  69.7  5e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0443  3-dehydroquinate dehydratase  28.49 
 
 
222 aa  67.4  2e-10  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.277554  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2806  3-dehydroquinate dehydratase  31.67 
 
 
300 aa  65.1  1e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0600  dehydroquinase class I  32.62 
 
 
234 aa  62.4  8e-09  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  22.67 
 
 
223 aa  61.6  1e-08  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2722  3-dehydroquinate dehydratase  29.52 
 
 
234 aa  60.8  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.96 
 
 
517 aa  60.8  2e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1495  3-dehydroquinate dehydratase  27.96 
 
 
235 aa  60.5  3e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.065136 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  21.78 
 
 
217 aa  57  3e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1182  3-dehydroquinate dehydratase  36.11 
 
 
224 aa  56.6  4e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  29.06 
 
 
294 aa  52.8  6e-06  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1295  dehydroquinase class I  27.75 
 
 
209 aa  51.2  2e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0951135  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  28.77 
 
 
295 aa  48.9  9e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.64 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0674  3-dehydroquinate dehydratase, putative  26.59 
 
 
236 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2603  dehydroquinase class I  29.44 
 
 
197 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.635582  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  31.43 
 
 
473 aa  45.8  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.73 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  36.25 
 
 
1161 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  36.25 
 
 
1161 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>