More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00790 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
269 aa  528  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  41.88 
 
 
252 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 
239 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  33.74 
 
 
238 aa  153  3e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  34.73 
 
 
246 aa  148  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 
233 aa  146  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  35.65 
 
 
233 aa  146  4e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  36.72 
 
 
248 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  36.44 
 
 
248 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  36.56 
 
 
238 aa  142  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  41.67 
 
 
226 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  34.51 
 
 
248 aa  138  8e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  34.02 
 
 
237 aa  135  6e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  35.43 
 
 
248 aa  135  6e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 
244 aa  135  7e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  32.8 
 
 
248 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  31.58 
 
 
238 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  29.63 
 
 
240 aa  131  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  33.2 
 
 
248 aa  131  1e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  32.82 
 
 
249 aa  129  4e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  31.62 
 
 
252 aa  127  2e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  33.89 
 
 
255 aa  125  8e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 
257 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 
267 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  28.87 
 
 
217 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  34.3 
 
 
252 aa  121  1e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  38.73 
 
 
268 aa  120  2e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  33.06 
 
 
252 aa  120  2e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  37.7 
 
 
259 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  38.32 
 
 
267 aa  119  4e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  33.62 
 
 
216 aa  119  4e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  7.93767e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1223  dihydrodipicolinate reductase  32.77 
 
 
212 aa  119  5e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 
267 aa  119  5e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  40.65 
 
 
268 aa  118  1e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  38.24 
 
 
267 aa  117  2e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  30.12 
 
 
240 aa  117  2e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  34.04 
 
 
216 aa  117  2e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  30.12 
 
 
240 aa  117  2e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  33.7 
 
 
284 aa  117  2e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  34.09 
 
 
278 aa  117  2e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  33.08 
 
 
263 aa  117  2e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  33.99 
 
 
261 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  37.14 
 
 
259 aa  115  8e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  37.44 
 
 
267 aa  115  1e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  31.69 
 
 
254 aa  115  1e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  33.09 
 
 
276 aa  114  2e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 
254 aa  114  2e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  34.18 
 
 
267 aa  114  2e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  38.65 
 
 
268 aa  114  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0450  dihydrodipicolinate reductase  39.9 
 
 
259 aa  114  2e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.303901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  33.08 
 
 
268 aa  114  2e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  38.65 
 
 
268 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  35.07 
 
 
263 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1170  dihydrodipicolinate reductase  30.99 
 
 
291 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  31.33 
 
 
251 aa  113  4e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  34.12 
 
 
263 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 
275 aa  112  7e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 
267 aa  112  8e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 
259 aa  111  1e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_002978  WD0370  dihydrodipicolinate reductase  30.34 
 
 
261 aa  111  1e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  38.03 
 
 
282 aa  111  1e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  36.45 
 
 
267 aa  111  2e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  34.22 
 
 
267 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 
271 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  4.0359e-05  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  39.22 
 
 
267 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  37.44 
 
 
267 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  35.55 
 
 
255 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 
267 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  34.94 
 
 
270 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.95261e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 
267 aa  109  4e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1810  dihydrodipicolinate reductase  38.56 
 
 
239 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.109637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  34.22 
 
 
267 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  36.76 
 
 
267 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  28.63 
 
 
240 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 
266 aa  108  7e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 
263 aa  108  7e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 
263 aa  108  7e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  34.95 
 
 
263 aa  108  7e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  35.35 
 
 
266 aa  108  8e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  6.18178e-10 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  34.83 
 
 
267 aa  108  8e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  35.81 
 
 
266 aa  108  8e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  38.31 
 
 
242 aa  108  8e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 
268 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  37.13 
 
 
273 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 
273 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  35.64 
 
 
267 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  32.54 
 
 
269 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  32.24 
 
 
267 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  36.82 
 
 
270 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  34.47 
 
 
271 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  31.23 
 
 
251 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  8.53274e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  33.67 
 
 
278 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  35.51 
 
 
265 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  3.25383e-07 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 
251 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  32.55 
 
 
273 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  31.97 
 
 
270 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  32.55 
 
 
273 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  32.55 
 
 
273 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  32.55 
 
 
273 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  34.35 
 
 
268 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>