More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
308 aa  623  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  56.23 
 
 
300 aa  307  2e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  51.99 
 
 
292 aa  284  1e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  6.0181e-05  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
292 aa  283  3e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 
297 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  50.37 
 
 
292 aa  276  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  47.57 
 
 
292 aa  272  5e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.31213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
292 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 
296 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 
290 aa  270  3e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  45.58 
 
 
296 aa  269  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
294 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 
297 aa  268  9e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
293 aa  267  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  48.21 
 
 
296 aa  267  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  47.27 
 
 
294 aa  265  5e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 
292 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  47.92 
 
 
298 aa  264  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
290 aa  263  2e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  47.14 
 
 
300 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  48.64 
 
 
319 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 
292 aa  263  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  48.58 
 
 
290 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  47.5 
 
 
301 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.02619e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  48.36 
 
 
290 aa  262  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  46.79 
 
 
300 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  46.79 
 
 
300 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  46.79 
 
 
300 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  46.79 
 
 
300 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  46.79 
 
 
300 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  46.79 
 
 
300 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  46.79 
 
 
300 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
293 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.5991e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  46.88 
 
 
293 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  47.87 
 
 
297 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  49.82 
 
 
290 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  46.79 
 
 
301 aa  259  5e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  1.82643e-07 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  47.14 
 
 
300 aa  259  5e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  47.14 
 
 
300 aa  259  5e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  49.45 
 
 
290 aa  259  5e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  47.14 
 
 
300 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  46.79 
 
 
301 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  48.1 
 
 
291 aa  258  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  46.79 
 
 
301 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
294 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  46.83 
 
 
290 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.6647e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 
297 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  48.25 
 
 
292 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 
294 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  45.65 
 
 
296 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  47.55 
 
 
292 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 
294 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 
296 aa  255  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  48.42 
 
 
294 aa  255  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  48.72 
 
 
290 aa  254  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  45.71 
 
 
320 aa  253  4e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  48.08 
 
 
291 aa  252  5e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  47.8 
 
 
300 aa  252  5e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  49.12 
 
 
298 aa  252  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 
289 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  44.3 
 
 
292 aa  252  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  46.45 
 
 
290 aa  252  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  2.42674e-09 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 
291 aa  252  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  45.13 
 
 
288 aa  251  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
296 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  47.67 
 
 
293 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  46.07 
 
 
302 aa  250  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  47.99 
 
 
291 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  44.76 
 
 
289 aa  249  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  45.1 
 
 
289 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  47 
 
 
287 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  49.28 
 
 
290 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  49.28 
 
 
290 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  48.2 
 
 
292 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  49.26 
 
 
296 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  45.76 
 
 
293 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  45.86 
 
 
292 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  44.72 
 
 
291 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 
292 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 
293 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  47.04 
 
 
292 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 
289 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
293 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  47.29 
 
 
298 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 
292 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  40.8 
 
 
297 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 
293 aa  246  5e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  47.18 
 
 
292 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 
307 aa  245  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  47.22 
 
 
300 aa  245  7e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  48.89 
 
 
296 aa  244  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  48.89 
 
 
296 aa  245  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  45.85 
 
 
298 aa  244  1e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  46.91 
 
 
296 aa  244  1e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  45.85 
 
 
298 aa  244  1e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
295 aa  244  1e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  47.06 
 
 
295 aa  244  1e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  48.38 
 
 
299 aa  243  2e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  43.86 
 
 
295 aa  243  2e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  46.69 
 
 
290 aa  243  2e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>