More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00770 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
424 aa  854  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  50.73 
 
 
408 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  50.12 
 
 
411 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  50.25 
 
 
411 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  51.22 
 
 
411 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  49.51 
 
 
411 aa  405  1e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  49.39 
 
 
411 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  49.39 
 
 
410 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.02 
 
 
411 aa  403  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  49.14 
 
 
411 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.73776e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  49.39 
 
 
410 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  49.5 
 
 
411 aa  399  1e-110  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  48.66 
 
 
410 aa  400  1e-110  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  3.42652e-12 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  50.37 
 
 
408 aa  399  1e-110  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  50.25 
 
 
407 aa  400  1e-110  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  48.66 
 
 
410 aa  400  1e-110  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  48.91 
 
 
410 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  47.42 
 
 
408 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  47.42 
 
 
408 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  48.04 
 
 
411 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  49.51 
 
 
407 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  49.27 
 
 
408 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  48.18 
 
 
409 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.07043e-08  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  48.04 
 
 
411 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  48.42 
 
 
410 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  48.28 
 
 
531 aa  393  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  47.69 
 
 
410 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  49.39 
 
 
411 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  47.92 
 
 
417 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  45.37 
 
 
408 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  44.74 
 
 
409 aa  381  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  44.88 
 
 
408 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  45.37 
 
 
408 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  45.72 
 
 
407 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  44.63 
 
 
408 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  46.91 
 
 
411 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  49.02 
 
 
408 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  47.3 
 
 
409 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  44.85 
 
 
404 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  46.31 
 
 
443 aa  341  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  43.11 
 
 
402 aa  328  1e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  40.54 
 
 
393 aa  307  2e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.58 
 
 
388 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  33 
 
 
391 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  32.9 
 
 
403 aa  154  3e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  32.89 
 
 
401 aa  154  3e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  33.33 
 
 
390 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.1377e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  32.04 
 
 
388 aa  148  2e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  31.43 
 
 
391 aa  148  2e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  31.17 
 
 
405 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  32.37 
 
 
405 aa  146  8e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.45 
 
 
388 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  31.5 
 
 
387 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  31.11 
 
 
402 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  35.26 
 
 
395 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  30 
 
 
406 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  29.15 
 
 
392 aa  142  1e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.68 
 
 
392 aa  142  1e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  31.58 
 
 
413 aa  142  1e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3411  aminotransferase  30.83 
 
 
406 aa  141  2e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3091  aminotransferase  30.83 
 
 
406 aa  141  2e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  30.05 
 
 
390 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  30.31 
 
 
405 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  30.75 
 
 
384 aa  140  5e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 
386 aa  140  5e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3522  aminotransferase  31.17 
 
 
406 aa  140  5e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0878596  normal  0.459618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  31.09 
 
 
402 aa  140  5e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3284  aminotransferase  30.57 
 
 
406 aa  140  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.081713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  30.55 
 
 
409 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2310  aminotransferase  29.65 
 
 
405 aa  139  8e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  31.19 
 
 
425 aa  139  9e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.05 
 
 
385 aa  139  9e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.87 
 
 
388 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1648  aminotransferase  28.54 
 
 
405 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  32.19 
 
 
407 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  30.39 
 
 
405 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.48 
 
 
385 aa  139  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  32.55 
 
 
406 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.67 
 
 
389 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5806  aminotransferase  30.81 
 
 
406 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  decreased coverage  0.00092388 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.35 
 
 
388 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  4.00869e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6029  aminotransferase  30.69 
 
 
406 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777497  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  32.55 
 
 
406 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.07 
 
 
389 aa  137  3e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  32.16 
 
 
402 aa  137  3e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  33.01 
 
 
384 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  32.43 
 
 
382 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 
392 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.73 
 
 
387 aa  136  9e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  29.41 
 
 
396 aa  135  1e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.1809e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  31.66 
 
 
407 aa  134  2e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  31.82 
 
 
382 aa  135  2e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 
391 aa  134  2e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2782  aminotransferase  29.61 
 
 
406 aa  135  2e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  30.53 
 
 
393 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  30.81 
 
 
403 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2967  aminotransferase  30.61 
 
 
406 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  30.13 
 
 
382 aa  134  4e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  30.03 
 
 
411 aa  133  7e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.43 
 
 
390 aa  132  1e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>